RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	MND1	P53102	219 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	PKP2	P53170	491 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	HOP2	P53187	214 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	JJJ1	P53863	590 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	PNG1	Q02890	363 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	MUB1	Q03162	620 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	GYL1	Q04322	720 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	SDH5	Q08230	162 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	RDR1	Q08904	546 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SLX1	YBR228W	JIP3	O13555	125 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	KAR3	P17119	729 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	RAD16	P31244	790 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	DBF4	P32325	704 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	RRT2	P38332	387 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	RCK2	P38623	610 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	HIS2	P38635	335 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	SMF1	P38925	575 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	RGI2	P40188	164 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	BRO1	P48582	844 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	SLG1	P54867	378 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	ARO80	Q04052	950 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	ERV41	Q04651	352 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	VPS54	Q12071	889 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	YLR462W	O13556	202 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	DPB3	P27344	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	TKL2	P33315	681 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	MIA40	P36046	403 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	YHL049C	P38722	271 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	MDM31	P38880	579 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	YER189W	P40104	122 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	YFL064C	P43540	174 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	SNZ3	P43545	298 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	SNZ2	P53824	298 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	VPS60	Q03390	229 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	ATG16	Q03818	150 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	FMP45	Q07651	309 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	GPM2	Q12008	311 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	EMP46	Q12396	444 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	AHC1	Q12433	566 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	PUT4	P15380	627 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	YCL049C	P25577	312 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	YEL043W	P32618	956 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	SRB2	P34162	210 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	PHD1	P36093	366 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	YBR056W	P38081	501 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	SIF2	P38262	535 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	PHO90	P39535	881 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	FMP10	P40098	244 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	MAL13	P53338	473 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	ADA2	Q02336	434 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	SMA2	Q04658	369 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	PRM6	Q04705	352 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	IVY1	Q04934	453 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	TAF10	Q12030	206 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	HRT3	Q12347	344 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	CCH1	P50077	2039 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	BYE1	P36106	594 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	SWC5	P38326	303 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	END3	P39013	349 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	AVT2	P39981	480 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	RPC17	P47076	161 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	REG1	Q00816	1014 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	URH1	Q04179	340 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	TAF9	Q05027	157 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	DDC1	Q08949	612 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	NBP2	Q12163	236 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	SFI1	Q12369	946 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	RAD10	P06838	210 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	MAS1	P10507	462 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SLX1	YBR228W	MRS3	P10566	314 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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