RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W-A

YBL008W-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YBL008W-A, Length 240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL008W-AYBL008W-A RQC1Q05468 723 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A MRPL35Q06678 367 aa1.31□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A ATG29Q12092 213 aa1.31□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A JID1Q12350 301 aa1.31□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A ADH2P00331 348 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A GAL80P04387 435 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A PRR1P28708 518 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A IMP2'P32351 346 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A MCM10P32354 571 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A MUD1P32605 298 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A CST26P38226 397 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A MSG5P38590 489 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A YHR054CP38780 354 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A DFG10P40526 253 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A OST1P41543 476 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A GAB1P41733 394 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A NCA3P46955 337 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A MRX6P48564 524 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A ARE2P53629 642 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A HAL1Q01766 294 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A HSP31Q04432 237 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A CMS1Q07897 291 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A REX4Q08237 289 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A CUE5Q08412 411 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A HSP42Q12329 375 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A RKM5Q12367 367 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A RRD2Q12461 358 aa1.3□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A TRP1P00912 224 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A PRB1P09232 635 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A SAM1P10659 382 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A SAM2P19358 384 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A TRX2P22803 104 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A SPB1P25582 841 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A APE2P32454 952 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A KAR9P32526 644 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A NIP100P33420 868 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A MRPS9P38120 278 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A VID24P38263 362 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A UTP18P40362 594 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data1.29□□□□□ -2.2not detected
YBL008W-AYBL008W-A HXT14P42833 540 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A YGR149WP48236 432 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A FMS1P50264 508 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A LCL3P53153 274 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A RTS3P53289 263 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A GOR1P53839 350 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A VHS1Q03785 461 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A PPM1Q04081 328 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A YBL111CQ3E7Y5 667 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A YML133CQ03099 1374 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A YLL067CQ07888 1374 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A YLL066CQ99208 1374 aa1.29□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A TEF1P02994 458 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A ATP10P18496 279 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A RPB5P20434 215 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A SNT1P25357 1226 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A AFG1P32317 509 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A NUP2P32499 720 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A RRP1P35178 278 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A CCT2P39076 527 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A YMR147WP40218 223 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A UPF3P48412 387 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A ALF1P53904 254 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A MTQ1P53944 314 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A RNY1Q02933 434 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A TAF12Q03761 539 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A ECM11Q04110 302 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A TAP42Q04372 366 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A AIM32Q04689 311 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A VTA1Q06263 330 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A IMH1Q06704 911 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A SNX3Q08826 162 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A PLP2Q12017 286 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A CEX1Q12453 761 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A ENT1Q12518 454 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A RTP1Q12751 981 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A YLR278CQ05854 1341 aa1.28□□□□□ -2.2
YBL008W-AYBL008W-A RIP1P08067 215 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A NFT1P0CE68 1218 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A RPI1P23250 407 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A PCL1P24867 279 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A DPH2P32461 534 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A PRP21P32524 280 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A NPL6P32832 435 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A MUD2P36084 527 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data1.27□□□□□ -2.21not detected
YBL008W-AYBL008W-A ESL1P40456 1118 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A MET18P40469 1032 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A SFH5P47008 294 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A MDE1P47095 244 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A PCP1P53259 346 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A JJJ1P53863 590 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A YDR239CQ03780 787 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A RIM20Q12033 661 aa1.27□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A PSK1P31374 1356 aa1.26□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A MRP7P12687 371 aa1.26□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A AAC3P18238 307 aa1.26□□□□□ -2.21
YBL008W-AYBL008W-A SPO7P18410 259 aa1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 86 ms