RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	MGE1	P38523	228 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	UBA4	P38820	440 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FET3	P38993	636 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SEN34	P39707	275 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YEL068C	P39977	110 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	AYR1	P40471	297 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PKP1	P40530	394 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	HOC1	P47124	396 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YDL186W	P48568	277 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SPC105	P53148	917 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	COG7	P53195	279 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SWC4	P53201	476 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MEP3	P53390	489 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RET3	P53600	189 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	VTC3	Q02725	835 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	VPS60	Q03390	229 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YPR114W	Q06107	315 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SUE1	Q06524	206 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	VAC14	Q06708	880 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CEX1	Q12453	761 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MDM12	Q92328	271 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CHS1	P08004	1131 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SAG1	P20840	650 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	AEP2	P22136	580 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SWI3	P32591	825 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NFU1	P32860	256 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CAB3	P36076	571 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TUL1	P36096	758 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	UBP13	P38187	747 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FMP23	P38231	175 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SIF2	P38262	535 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YBR184W	P38299	523 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RTT107	P38850	1070 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	VPS52	P39904	641 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YIL012W	P40551	113 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YIR020C	P40575	100 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BUD8	P41698	603 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SIP4	P46954	829 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TOM22	P49334	152 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	KEL2	P50090	882 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NPY1	P53164	384 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YGR079W	P53249	370 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MKC7	P53379	596 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YNL144C	P53907	740 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SED5	Q01590	340 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RPM2	Q02773	1202 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	UFO1	Q04511	668 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MRPL1	Q04599	285 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RSC3	Q06639	885 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	IPK1	Q06667	281 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YLR046C	Q12253	270 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SMC6	Q12749	1114 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YOR019W	Q99248	730 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	VCX1	Q99385	411 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BIK1	P11709	440 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ROX3	P25046	220 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GEX1	P25596	615 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MRP8	P35719	219 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.43	□□□□□ -2.34	not detected
AI1	Q0050	ELF1	P36053	145 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GEX2	P36173	615 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YSW1	P38280	609 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	LNP1	P38878	278 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MNL1	P38888	796 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	STL1	P39932	569 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GAT2	P40209	560 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PXA1	P41909	870 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YJL049W	P47048	450 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ORC5	P50874	479 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TPO2	P53283	614 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	JJJ1	P53863	590 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GTR1	Q00582	310 aa		0.43	□□□□□ -2.34

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