RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621629.4

FAM58A-208, Transcript of Cyclin-related protein FAM58A, human

TSL 5

Gene FAM58A, Length 1,220 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM58A-208	ENST00000621629	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FAM58A-208	ENST00000621629	IQCF3	P0C7M6	154 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	CALM1	P0DP23	149 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	CALM2	P0DP24	149 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	CALM3	P0DP25	149 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	CDC45	O75419	566 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	SEMA3F	Q13275	785 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	RNF20	Q5VTR2	975 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	FANCB	Q8NB91	859 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	SPATA33	Q96N06	139 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	ALG1	Q9BT22	464 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	NOD1	Q9Y239	953 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	PIK3CD	O00329	1044 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	PFKM	P08237	780 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	MFSD10	Q14728	455 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	NEK1	Q96PY6	1258 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	PPFIA4	O75335	1185 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	ICAM3	P32942	547 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	BFSP2	Q13515	415 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	RETREG2	Q8NC44	543 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	RFC2	P35250	354 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	MICU3	Q86XE3	530 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	STAM2	O75886	525 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	FOSL2	P15408	326 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	HIC1	Q14526	733 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	GPNMB	Q14956	572 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	C7orf31	Q8N865	590 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	CAGE1	Q8TC20	777 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FAM58A-208	ENST00000621629	RAB30	Q15771	203 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	APOA5	Q6Q788	366 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	CUL5	Q93034	780 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	ZBBX	A8MT70	800 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	RABGGTB	P53611	331 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	RBL2	Q08999	1139 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	MSRA	Q9UJ68	235 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	WNT8B	Q93098	351 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	FIBP	O43427	364 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	MYOG	P15173	224 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	FUT2	Q10981	343 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	33.22	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	KCNB2	Q92953	911 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	PTPRS	Q13332	1948 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	CKB	P12277	381 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	SELP	P16109	830 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	NEDD9	Q14511	834 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	UBE2S	Q16763	222 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	METTL7B	Q6UX53	244 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	33.21	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	DLL1	O00548	723 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	LGALS2	P05162	132 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	ACTN1	P12814	892 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	PTK7	Q13308	1070 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	GPR20	Q99678	358 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FAM58A-208	ENST00000621629	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		33.2	■■■□□ 2.91

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