RNA–Protein interactions for RNA: YKL169C

YKL169C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL169C, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL169C	YKL169C	RPN14	P53196	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	POS5	Q06892	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	VPS54	Q12071	889 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
YKL169C	YKL169C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	SUC2	P00724	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	GAL7	P08431	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	DAP2	P18962	818 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	GEX1	P25596	615 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YIM1	P28625	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	NTG1	P31378	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	HCS1	P34243	683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YUH1	P35127	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	SLM4	P38247	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	MLC1	P53141	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	BUD32	P53323	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	AQR1	P53943	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	NUP100	Q02629	959 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	PPM1	Q04081	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	COQ11	Q05892	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	ARV1	Q06541	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	PEP5	P12868	1029 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	RPB8	P20436	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	MSN2	P33748	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	DUG2	P38149	878 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YIL024C	P40543	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YJR154W	P47181	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YGR266W	P53326	701 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	RHO4	Q00246	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	THP1	Q08231	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	UBX3	Q12229	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKL169C	YKL169C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	PET123	P17558	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RAD14	P28519	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SNC1	P31109	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	COY1	P34237	679 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	CAB3	P36076	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ROT2	P38138	954 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	CTM1	P38818	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YTA12	P40341	825 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	GAT1	P43574	510 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YGR149W	P48236	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YPT11	P48559	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	FMS1	P50264	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SEG1	Q04279	960 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SIL1	Q08199	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	HIP1	P06775	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SPS4	P09937	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	STV1	P37296	890 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	COS5	P47187	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	DUG3	P53871	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SKO1	Q02100	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SHR3	Q02774	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	EKI1	Q03764	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RIM13	Q03792	727 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	COS7	Q07788	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	UAF30	Q08747	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RAV1	P47104	1357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RHO2	P06781	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	GID7	P25569	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	AFG1	P32317	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ATP11	P32453	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	SPC34	P36131	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	BNA4	P38169	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	VPS25	P47142	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	TOM22	P49334	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	LSB1	P53281	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	ECI1	Q05871	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL169C	YKL169C	THI7	Q05998	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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