RNA–Protein interactions for RNA: YGR247W

CPD1, Transcript of Cyclic nucleotide phosphodiesterase, yeastyeast

Gene CPD1, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1YGR247W BNA3P47039 444 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W EFM5P53200 248 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W IBD2P53892 351 aa8.49□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W TAF11Q04226 346 aa8.49□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W REX4Q08237 289 aa8.49□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W RUP1Q12242 671 aa8.49□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W YPL247CQ12523 523 aa8.49□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W SPT3P06844 337 aa8.48□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W PHO2P07269 559 aa8.48□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W RPB10P22139 70 aa8.48□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W FUN30P31380 1131 aa8.48□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W YEL043WP32618 956 aa8.48□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W CBP4P37267 147 aa8.48□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W SEA4P38164 1038 aa8.48□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W YBR071WP38243 211 aa8.48□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W SEC27P41811 889 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data8.48□□□□□ -1.05not detected
CPD1YGR247W RMI1Q02685 241 aa8.48□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W CYK3Q07533 885 aa8.48□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W DBP2P24783 546 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W ZIP1P31111 875 aa8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W RRP14P36080 434 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W REI1P38344 393 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W PRM2P40534 656 aa8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W VMA13P41807 478 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W BSC5P53755 489 aa8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W LSM3P57743 89 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W SHR3Q02774 210 aa8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W VPS16Q03308 798 aa8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W APC4Q04601 652 aa8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W RIF2Q06208 395 aa8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W MDM32Q12171 622 aa8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W YPR064WQ12492 139 aa8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W Q0010Q9ZZX9 128 aa8.47□□□□□ -1.05
CPD1YGR247W VPS33P20795 691 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W NPR1P22211 790 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W MRPL25P23369 157 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data8.46□□□□□ -1.06not detected
CPD1YGR247W RRN3P36070 627 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W SPC42P36094 363 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W VRP1P37370 817 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W ALG3P38179 458 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W BMT2P38278 337 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TPA1P40032 644 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W PRM10P42946 383 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W PMT4P46971 762 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W YMR209CQ03648 457 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W PDR8Q06149 701 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W YLR049CQ12110 428 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W MHT1Q12525 324 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W RMP1Q12530 201 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TY2A-FP0CX61 438 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TY2A-GR2P0CX62 438 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W SGV1P23293 657 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TY2A-CP25383 438 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W PHA2P32452 334 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W UTP25P40498 721 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W YGL176CP46945 554 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W STE24P47154 453 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W SPT20P50875 604 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W MAL11P53048 616 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W YGR053CP53234 283 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W YNL058CP53947 316 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W YPL109CQ02981 657 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TY2A-DR2Q03483 438 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W YMR155WQ03795 547 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W MCH5Q08777 521 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W SLP1Q12232 587 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TY2A-BQ12260 438 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TY2A-OR2Q12293 438 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TY2A-DR1Q12392 438 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TY2A-OR1Q12439 438 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TY2A-DR3Q99303 438 aa8.45□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W SPB1P25582 841 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W DPB3P27344 201 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W MLS1P30952 554 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W COX13P32799 129 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W LHS1P36016 881 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W IFA38P38286 347 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W TDA11P38854 504 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W REV7P38927 245 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W AXL1P40851 1208 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W YJR115WP47152 169 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W PNP1Q05788 311 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W SEC10Q06245 871 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W NMD4Q12129 218 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W YCL012CQ8J0M4 134 aa8.44□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W ADH4P10127 382 aa8.43□□□□□ -1.06
CPD1YGR247W APN1P22936 367 aa8.43□□□□□ -1.06
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