RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	VHC1	P38329	1120 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YHR112C	P38716	378 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	TDA11	P38854	504 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	NDE1	P40215	560 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YGR015C	P53208	328 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	VAM6	Q07468	1049 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YOR376W	Q08900	122 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	MMT2	Q08970	484 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	NUS1	Q12063	375 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	COX17	Q12287	69 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	CDC21	P06785	304 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	IMA3	P0CW40	589 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	IMA4	P0CW41	589 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	RRN10	P38204	145 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	AXL2	P38928	823 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	GGC1	P38988	300 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	END3	P39013	349 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	SCC4	P40090	624 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YMR134W	P40207	237 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YJR149W	P47177	404 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	RPN14	P53196	417 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	MPS1	P54199	764 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	SOV1	Q04748	898 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YPS7	Q06325	596 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	XYL2	Q07993	356 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	IMA2	Q08295	589 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	MDM32	Q12171	622 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	STE2	D6VTK4	431 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.47	□□□□□ -1.53	not detected
SYF2	YGR129W	ATP12	P22135	325 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	MGR1	P25573	417 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	HXT1	P32465	570 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	NFU1	P32860	256 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	BEM3	P32873	1128 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	KKQ8	P36004	724 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	RCK2	P38623	610 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	TAT2	P38967	592 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	VPS52	P39904	641 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	MEP1	P40260	492 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	AZF1	P41696	914 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YFL012W	P43580	148 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	BIO3	P50277	480 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	ATG4	P53867	494 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	YSA1	Q01976	231 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	SPP2	Q02521	185 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	CYK3	Q07533	885 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	BAG7	Q12128	409 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	ICT1	Q12385	394 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SYF2	YGR129W	SOD2	P00447	233 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YMC1	P32331	307 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	SRB4	P32569	687 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	TOD6	P34219	525 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MDM34	P53083	459 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	BTN2	P53286	410 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	NUP116	Q02630	1113 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RGT2	Q12300	763 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	TCD1	P38756	429 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YDR089W	P38966	869 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ICE2	P40499	491 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	TIM54	P47045	478 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ATG21	Q02887	496 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	PEP5	P12868	1029 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RSR1	P13856	272 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RAD57	P25301	460 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	SSH4	P32343	579 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	DCG1	P32460	244 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YSC84	P32793	468 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	EFM1	P38732	585 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MNN1	P39106	762 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	HAT2	P39984	401 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	TOK1	P40310	691 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RTA1	P53047	317 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YPL068C	Q02749	293 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	OAZ1	Q02803	292 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YMR210W	Q03649	449 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	GLO2	Q05584	274 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RCN2	Q12044	265 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YRM1	Q12340	786 aa		5.44	□□□□□ -1.54

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