RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DSD1	P53095	428 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	IMO32	P53219	342 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MPS1	P54199	764 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DID2	P69771	204 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ACS1	Q01574	713 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SED5	Q01590	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	OSH6	Q02201	448 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SHR3	Q02774	210 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	FMN1	Q03778	218 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GAL83	Q04739	417 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ECI1	Q05871	280 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YLR352W	Q06479	807 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YLL007C	Q07799	665 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TRE2	Q08693	809 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
ECO1	YFR027W	AFT2	Q08957	416 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	HMS1	Q12398	434 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ARP7	Q12406	477 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NCB2	Q92317	146 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SPO14	P36126	1683 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	URA3	P03962	267 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CBP3	P21560	335 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PEX3	P28795	441 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DGR2	P32330	852 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YKL133C	P36066	463 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RRN3	P36070	627 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NUP133	P36161	1157 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ARA1	P38115	344 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DUG2	P38149	878 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YBR138C	P38277	524 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.87	not detected
ECO1	YFR027W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PSF2	P40359	213 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	THI6	P41835	540 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	FET5	P43561	622 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	BNA6	P43619	295 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	IMA1	P53051	589 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	MLC1	P53141	149 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	OKP1	P53298	406 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	CAF40	P53829	373 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	YMR027W	Q04371	470 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	COQ9	Q05779	260 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	COQ11	Q05892	277 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	BUR2	Q05949	395 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	FEX2	Q08991	375 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	FMP16	Q12497	93 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	AVL9	Q12500	764 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	TMA17	Q12513	150 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	LAG2	Q92325	660 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	RAD61	Q99359	647 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ECO1	YFR027W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TPK2	P06245	380 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	CLN3	P13365	580 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	HOP1	P20050	605 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	RIT1	P23796	513 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	VMA16	P23968	213 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	AAD3	P25612	363 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	DAL80	P26343	269 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PRR1	P28708	518 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SPT14	P32363	452 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TFC1	P32367	649 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PPQ1	P32945	549 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TSC10	P38342	320 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	MSR1	P38714	643 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	PPE1	P38796	400 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YDR089W	P38966	869 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	EXO1	P39875	702 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	LRO1	P40345	661 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	UFE1	P41834	346 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YGR210C	P42942	411 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YFR018C	P43599	363 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ABM1	P47146	123 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	TOM22	P49334	152 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	YGL117W	P53133	265 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ECO1	YFR027W	USE1	P53146	245 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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