RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	SPE4	Q12455	300 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SAS5	Q99314	248 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	REP2	P03872	296 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	BI2	P03873	423 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
XRS2	YDR369C	GCR1	P07261	785 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MOD5	P07884	428 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	UTR1	P21373	530 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	DAL81	P21657	970 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SIR1	P21691	654 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	FPS1	P23900	669 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	POF1	P25576	258 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	DAL3	P32459	195 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ISC10	P32645	267 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MRPL15	P36523	253 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
XRS2	YDR369C	AVT5	P38176	459 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YBL036C	P38197	257 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	APM2	P38700	605 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MLH1	P38920	769 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	NPR2	P39923	615 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	TGL3	P40308	642 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	IDP2	P41939	412 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	NNF1	P47149	201 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	GET1	P53192	235 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ARK1	P53974	638 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MFB1	Q04922	465 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MDM30	Q05930	598 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PSR2	Q07949	397 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YOL019W	Q08157	551 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ESA1	Q08649	445 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	UAF30	Q08747	228 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MDM32	Q12171	622 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PNS1	Q12412	539 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	MPD2	Q99316	277 aa		3.54	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	HTB2	P02294	131 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	TPK1	P06244	397 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	NUC1	P08466	329 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	COS2	P0CX12	379 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	COS3	P0CX13	379 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PHO81	P17442	1178 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	PPG1	P32838	368 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CTF13	P35203	478 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	AIM29	P36154	155 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	VHC1	P38329	1120 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CFD1	P40558	293 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	IMA5	P40884	581 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.53	□□□□□ -1.84	not detected
XRS2	YDR369C	YJL107C	P42947	387 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YJR056C	P47115	236 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YDL183C	P48569	320 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	POP6	P53218	158 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YGR042W	P53227	271 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	CBK1	P53894	756 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	STP1	Q00947	519 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SMA2	Q04658	369 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RCO1	Q04779	684 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	GAS2	Q06135	555 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YPR078C	Q06813	372 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	THI20	Q08224	551 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	YLR053C	Q12026	108 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	APC9	Q12107	265 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	AFI1	Q99222	893 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	ECM3	Q99252	613 aa		3.53	□□□□□ -1.84
XRS2	YDR369C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	IFM1	P25038	676 aa		3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	CPR4	P25334	318 aa		3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	LDS1	P31379	325 aa		3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SPR1	P32603	445 aa		3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SPO23	P33757	523 aa		3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	LST4	P34239	828 aa		3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	MMS4	P38257	691 aa		3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	SLI15	P38283	698 aa		3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YEL020C	P39994	560 aa		3.53	□□□□□ -1.85
XRS2	YDR369C	YIL166C	P40445	542 aa		3.53	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59 ms