RNA–Protein interactions for RNA: YDR297W

SUR2, Transcript of Sphinganine C4-hydroxylase, yeast

Gene SUR2, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUR2	YDR297W	YHI9	P38765	294 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	MRX1	P40050	688 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YER186C	P40101	306 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	SLM1	P40485	686 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	MAD2	P40958	196 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	SIP4	P46954	829 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	TAM41	P53230	385 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YNL181W	P53878	407 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	BOP3	P53958	396 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	SLD5	Q03406	294 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	AIM32	Q04689	311 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	ARG7	Q04728	441 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	SOV1	Q04748	898 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	MSC3	Q05812	728 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	DUS4	Q06063	367 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	ATG23	Q06671	453 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	TGS1	Q12052	315 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	DAS2	Q12084	232 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	ECM29	P38737	1868 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	REP1	P03871	373 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	ITR2	P30606	609 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	TVP38	P36164	337 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	MRPL37	P36532	105 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YER184C	P39961	794 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	NPP2	P39997	493 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	PIG2	P40187	538 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	UFE1	P41834	346 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	OTU1	P43558	301 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	MPS3	P47069	682 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	AVT1	P47082	602 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	BRO1	P48582	844 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	SGF73	P53165	657 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YGR042W	P53227	271 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YGR066C	P53242	292 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	COQ6	P53318	479 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	NGL3	Q03210	505 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	TPP1	Q03796	238 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	GTB1	Q04924	702 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	GET4	Q12125	312 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	NTO1	Q12311	748 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SUR2	YDR297W	PDE2	P06776	526 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SEC12	P11655	471 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	DAP2	P18962	818 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	RPO26	P20435	155 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	RGT1	P32862	1170 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SRP101	P32916	621 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	BZZ1	P38822	633 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	WSS1	P38838	269 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SMF1	P38925	575 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YER085C	P40058	173 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	RTS2	P40962	232 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CUL3	P53202	744 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	RTT102	P53330	157 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YNR071C	P53757	342 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	REC102	Q02721	264 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	HPF1	Q05164	967 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	COQ9	Q05779	260 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	DCR2	Q05924	578 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SPO77	Q06134	477 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	ULA1	Q12059	462 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SVS1	Q12254	260 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	HMS1	Q12398	434 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MOT1	P32333	1867 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MRP10	O75012	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	CBS1	P14066	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
SUR2	YDR297W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	SRL3	P36167	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SUR2	YDR297W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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