RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W GUK1P15454 187 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SEN2P16658 377 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SEC2P17065 759 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SPT14P32363 452 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W MF(ALPHA)2P32435 120 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W TKL2P33315 681 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YKL063CP35725 167 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W EFM1P38732 585 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W IST3P40565 148 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W TOM22P49334 152 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SNF12P53628 566 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W NUP49Q02199 472 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W NOG1Q02892 647 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W PFA5Q03289 374 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W PMT7Q06644 662 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W GSH2Q08220 491 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W ATG29Q12092 213 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W LSO1Q3E827 93 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YBL113CQ7M4S9 792 aa10.06□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SPT3P06844 337 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W DAP2P18962 818 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W PHO3P24031 467 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YHK8P38776 514 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W HXT6P39003 570 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W HXT7P39004 570 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W ACO2P39533 789 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W PEA2P40091 420 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W RGI2P40188 164 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SER2P42941 309 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W ALR2P43553 858 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W BST1P43571 1029 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W MRX6P48564 524 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W CAF120P53836 1060 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W PEX13P80667 386 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W GRX5Q02784 150 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W MUK1Q02866 612 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W ACF2Q12168 779 aa10.05□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W RAS2P01120 322 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W GAL80P04387 435 aa10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YBR242WP38331 238 aa10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W PNT1P38969 423 aa10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W DHH1P39517 506 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SOK1P40317 901 aa10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data10.04□□□□□ -0.8not detected
PRP4YPR178W YGR168CP53293 376 aa10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W RBG2P53295 368 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YLR345WQ06137 509 aa10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W GRS2Q06817 618 aa10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W MLH3Q12083 715 aa10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W PNS1Q12412 539 aa10.04□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W CDC4P07834 779 aa10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W HMG1P12683 1054 aa10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W GAL3P13045 520 aa10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W RSA4P25382 515 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W COG3P40094 801 aa10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W GCV2P49095 1034 aa10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YPT32P51996 222 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W IMP4P53941 290 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W REG1Q00816 1014 aa10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W MAK3Q03503 176 aa10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W RNH1Q04740 348 aa10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YDL199CQ12407 687 aa10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SAR1P20606 190 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W PPQ1P32945 549 aa10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W CTF13P35203 478 aa10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W AHP1P38013 176 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W UBX7P38349 436 aa10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W MIT1P40002 666 aa10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W ISC1P40015 477 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YGR266WP53326 701 aa10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SPC98P53540 846 aa10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W IDP3P53982 420 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W EMI1Q04406 187 aa10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W MCA1Q08601 432 aa10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W RTR2Q12378 196 aa10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W YPR1Q12458 312 aa10.02□□□□□ -0.8
PRP4YPR178W SEA4P38164 1038 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W VMA7P39111 118 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W PCL6P40038 420 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W ALD5P40047 520 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W SSY5P47002 699 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W SNX4P47057 423 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W BIO3P50277 480 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W IRC15Q02733 499 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W ISU1Q03020 165 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W SWA2Q06677 668 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W RAX1Q08760 435 aa10.01□□□□□ -0.81
PRP4YPR178W MCD1Q12158 566 aa10.01□□□□□ -0.81
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