RNA–Protein interactions for RNA: YPR017C

DSS4, Transcript of Guanine nucleotide dissociation stimulator for Sec4p, yeast

Gene DSS4, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS4	YPR017C	DMC1	P25453	334 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	BRF1	P29056	596 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	BEM1	P29366	551 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	GDA1	P32621	518 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	PMT1	P33775	817 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	TOM20	P35180	183 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YSW1	P38280	609 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SEO1	P39709	593 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YJR061W	P40355	935 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	BAP3	P41815	604 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	COQ5	P49017	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SWC4	P53201	476 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	REC102	Q02721	264 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	USA1	Q03714	838 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YET3	Q07451	203 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SEM1	O94742	89 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	AMD2	P22580	549 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	BEM3	P32873	1128 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	CYM1	P32898	989 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	OAF3	P36023	863 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	STB6	P36085	766 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SET3	P36124	751 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	TAE1	P38340	232 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YHR112C	P38716	378 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YHI9	P38765	294 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	RPH1	P39956	796 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	ALG8	P40351	577 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	IME4	P41833	600 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YFR018C	P43599	363 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YGL108C	P53139	140 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	BUD32	P53323	261 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	BIO4	P53630	237 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	AQR1	P53943	586 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YNL058C	P53947	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	OSH6	Q02201	448 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	TFB2	Q02939	513 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	CIA1	Q05583	330 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	VTA1	Q06263	330 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	BUD7	Q08754	746 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	MSB2	P32334	1306 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
DSS4	YPR017C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YCR051W	P25631	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YCR099C	P25657	155 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	PHA2	P32452	334 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	PHO11	P35842	467 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	TDP1	P38319	544 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	PHO12	P38693	467 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	DBP8	P38719	431 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	MNN1	P39106	762 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	TIM17	P39515	158 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YJL206C	P39529	758 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	DSN1	P40568	576 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	PET130	P47065	347 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	MTL1	P53214	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	COX18	P53239	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	FRE4	P53746	719 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SPP2	Q02521	185 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SMA1	Q02651	245 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	CCE1	Q03702	353 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	TAF11	Q04226	346 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	RCO1	Q04779	684 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	YML053C	Q04978	212 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	FAR8	Q05040	523 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	BLS1	Q06071	122 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SFH1	Q06168	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	NUS1	Q12063	375 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	RMD5	Q12508	421 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	RGS2	Q99188	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSS4	YPR017C	SUC2	P00724	532 aa		4.08	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
DSS4	YPR017C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.4 ms