RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	PHD1	P36093	366 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YIL169C	P40442	995 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	FET5	P43561	622 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	SNG1	P46950	547 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	PET130	P47065	347 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	MET17	P06106	444 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	CKA1	P15790	372 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YCR043C	P25361	127 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YME1	P32795	747 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	CST26	P38226	397 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	EFM2	P38347	419 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	MSR1	P38714	643 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	SMA1	Q02651	245 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	SHR3	Q02774	210 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	COQ9	Q05779	260 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	SRL1	Q08673	210 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	BSC1	Q12140	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MTD1	YKR080W	PRD1	P25375	712 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	MRE11	P32829	692 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	VID24	P38263	362 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	MET30	P39014	640 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	MET18	P40469	1032 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	TOF2	Q02208	771 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	TAF11	Q04226	346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RIM20	Q12033	661 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
MTD1	YKR080W	ARP6	Q12509	438 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	PEP5	P12868	1029 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RED1	P14291	827 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	ROX1	P25042	368 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RAD24	P32641	659 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	MIC60	P36112	540 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YHR210C	P38893	341 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	AXL1	P40851	1208 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	TWF1	P53250	332 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	MSS11	Q03825	758 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	FMP42	Q04991	504 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	DIC1	Q06143	298 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	HKR1	P41809	1802 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	HNM1	P19807	563 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	TYR1	P20049	452 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	ELO2	P25358	347 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SPC34	P36131	295 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RKM3	P38222	552 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SNM1	P40993	198 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	AZF1	P41696	914 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	BUD32	P53323	261 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	JJJ1	P53863	590 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RHO4	Q00246	291 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	ATG29	Q12092	213 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	POM152	P39685	1337 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	GPI10	P30777	616 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SHP1	P34223	423 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	MUM2	P38236	366 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	AIM22	P47051	409 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	NUP53	Q03790	475 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	FMP45	Q07651	309 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	THP1	Q08231	455 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	GRX6	Q12438	231 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	RTN2	Q12443	393 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SEC39	Q12745	709 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	BAR1	P12630	587 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	ACH1	P32316	526 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	TRS65	P32893	560 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	CMC1	P36064	111 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	SMF1	P38925	575 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YER130C	P39959	443 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	YIR014W	P40570	242 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MTD1	YKR080W	STB2	P46679	850 aa		4.11	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.7 ms