RNA–Protein interactions for RNA: YKL177W

YKL177W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL177W, Length 339 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL177W	YKL177W	SNC1	P31109	117 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	HIR2	P32480	875 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	MMS4	P38257	691 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	VHC1	P38329	1120 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	YJL132W	P47014	750 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	YJR154W	P47181	346 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	SSK1	Q07084	712 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	AEP3	Q12089	606 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	HSP42	Q12329	375 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	RIP1	P08067	215 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	ECM27	P47144	725 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	YPT11	P48559	417 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	RHO4	Q00246	291 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	NUP100	Q02629	959 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	DCS1	Q06151	350 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
YKL177W	YKL177W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	SUC2	P00724	532 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	KRE2	P27809	442 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	ATP11	P32453	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	GYP6	P32806	458 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	YIL024C	P40543	189 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	CFD1	P40558	293 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	POP1	P41812	875 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	ALT2	P52892	507 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	YNL234W	P53857	426 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	CRC1	Q12289	327 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	RRD2	Q12461	358 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKL177W	YKL177W	YPR089W	O13585	888 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	BAR1	P12630	587 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	GID7	P25569	745 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	MSP1	P28737	362 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	BEM1	P29366	551 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	REC114	P32841	428 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	SCO2	P38072	301 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	SYG1	P40528	902 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	TOM22	P49334	152 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	SMA1	Q02651	245 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	EKI1	Q03764	534 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	ECI1	Q05871	280 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	DIC1	Q06143	298 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	MTR10	Q99189	972 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	GEX1	P25596	615 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
YKL177W	YKL177W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	SIN4	P32259	974 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	DAD2	P36162	133 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	FLO5	P38894	1075 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	FAD1	P38913	306 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	POP2	P39008	433 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	VHS2	P40463	436 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	GAT1	P43574	510 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	TOF1	P53840	1238 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	RHB1	P25378	209 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	UTR4	P32626	227 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	PDR3	P33200	976 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	PHD1	P36093	366 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	CBP4	P37267	147 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	YPK3	P38070	525 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	WSS1	P38838	269 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	RTS2	P40962	232 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	IAH1	P41734	238 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	MLC1	P53141	149 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	YNL181W	P53878	407 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	OCA2	P53949	197 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	IZH1	Q03419	316 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	PPM1	Q04081	328 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	GLO2	Q05584	274 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	ARP6	Q12509	438 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKL177W	YKL177W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75

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