RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	IFA38	P38286	347 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	YAP3	P38749	330 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	VID30	P53076	958 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	BTN2	P53286	410 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	BLS1	Q06071	122 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	NYV1	Q12255	253 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	YLR302C	O13544	120 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	TOP1	P04786	769 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	MRPS28	P21771	286 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	RER1	P25560	188 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	HXT1	P32465	570 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	YME2	P32843	850 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	XRS2	P33301	854 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	BUR6	P40096	142 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	RIC1	P40395	1056 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SDT1	P53078	280 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SPO19	Q03029	223 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	MUB1	Q03162	620 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	HOT1	Q03213	719 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	ECM30	Q06673	1274 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	HNT3	Q08702	217 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SWI1	P09547	1314 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	YIL177C	P40434	1758 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	YJL225C	P40889	1758 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	CDC16	P09798	840 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	APE1	P14904	514 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	LSB5	P25369	354 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.92	□□□□□ -1.94	not detected
SYS1	YJL004C	HEL1	P36113	551 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SRO77	P38163	1010 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	MTC6	P38849	526 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	UME6	P39001	836 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	ELO1	P39540	310 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	VPS52	P39904	641 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	ALG8	P40351	577 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	DIA3	P52290	468 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	TLG1	Q03322	224 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	INP2	Q03824	705 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	ARO80	Q04052	950 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SKG3	Q06315	1026 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	ENT4	Q07872	247 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	YDL009C	Q12210	107 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	NFI1	Q12216	726 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	TY4B-J	P47024	1803 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	RPO26	P20435	155 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	CLN1	P20437	546 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	DPB3	P27344	201 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	CNS1	P33313	385 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SPT8	P38915	602 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	PSD1	P39006	500 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SMK1	P41808	388 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	ALT2	P52892	507 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	MAL13	P53338	473 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	RSM23	Q01163	450 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	CIA1	Q05583	330 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SFH1	Q06168	426 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	TFC6	Q06339	672 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	PSR1	Q07800	427 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	SAC3	P46674	1301 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYS1	YJL004C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	ADH7	P25377	361 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	NUF2	P33895	451 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	YSW1	P38280	609 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	SHO1	P40073	367 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	SLZ1	P40167	298 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	RCO1	Q04779	684 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	STE23	Q06010	1027 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	SYO1	Q07395	620 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	CTI6	Q08923	506 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYS1	YJL004C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28 ms