RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	ATR1	P13090	542 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	CBS1	P14066	229 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	YCK1	P23291	538 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	TUL1	P36096	758 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	LAG1	P38703	411 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	SPT8	P38915	602 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	YSA1	Q01976	231 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	MGR3	Q04472	501 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	YLH47	Q06493	454 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	HNT3	Q08702	217 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	FRE6	Q12473	712 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	HEM2	P05373	342 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.79	□□□□□ -1.8	not detected
NEM1	YHR004C	CLC1	P17891	233 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	DAL80	P26343	269 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	UBP11	P36026	717 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	DAD2	P36162	133 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	UIP3	P39547	235 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	CSM2	P40465	213 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	LCB2	P40970	561 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	ZIM17	P42844	174 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	MRX6	P48564	524 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	YGR066C	P53242	292 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	GLO2	Q05584	274 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.79	□□□□□ -1.8	not detected
NEM1	YHR004C	ATG9	Q12142	997 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	INP53	Q12271	1107 aa		3.79	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	CLB1	P24868	471 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	YCR051W	P25631	222 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	REG2	P38232	338 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	SMF1	P38925	575 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	VPS4	P52917	437 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	GRX3	Q03835	250 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	RAD30	Q04049	632 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	AIM32	Q04689	311 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	YLR345W	Q06137	509 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	DIC1	Q06143	298 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	GRX6	Q12438	231 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	SEC39	Q12745	709 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	ARG81	P05085	880 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.77	□□□□□ -1.81	not detected
NEM1	YHR004C	CPR2	P23285	205 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	MRP20	P32387	263 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	IME2	P32581	645 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	GYP6	P32806	458 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	PMU1	P36069	295 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	STB6	P36085	766 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	VID24	P38263	362 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	ANS1	P38832	159 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YHR131C	P38835	850 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	VPS45	P38932	577 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	DSD1	P53095	428 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YPL107W	Q02873	248 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SKG3	Q06315	1026 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	TCO89	Q08921	799 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	OM45	P16547	393 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	AAD10	P47182	288 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	ARP5	P53946	755 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	MUB1	Q03162	620 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	TFB1	P32776	642 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	NIP100	P33420	868 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	not detected
NEM1	YHR004C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	not detected
NEM1	YHR004C	MET18	P40469	1032 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	MET28	P40573	187 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	TOF1	P53840	1238 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEM1	YHR004C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81

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