RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	CPR4	P25334	318 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	ITR1	P30605	584 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.48	□□□□□ -2.33	not detected
CSE1	YGL238W	YHL041W	P38730	149 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	SEO1	P39709	593 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	HAL1	Q01766	294 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	ESA1	Q08649	445 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	RDR1	Q08904	546 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TRM8	Q12009	286 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	RSF2	P46974	1380 aa		0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	YKL100C	P34248	587 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	CCT6	P39079	546 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	SLZ1	P40167	298 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	IME4	P41833	600 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	AHC1	Q12433	566 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	YOL087C	Q99247	1116 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	MRP20	P32387	263 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	MID2	P36027	376 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	MUM2	P38236	366 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TOF1	P53840	1238 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	EFM6	P53970	246 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	MET14	Q02196	202 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	YMR160W	Q03823	816 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	RRN11	Q04712	507 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	MFB1	Q04922	465 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	SPE4	Q12455	300 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	TEL1	P38110	2787 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	SGF29	P25554	259 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	DSD1	P53095	428 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	BSC5	P53755	489 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	HXT11	P54862	567 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	RSM23	Q01163	450 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	IES4	Q08561	116 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	MPD2	Q99316	277 aa		0.47	□□□□□ -2.33
CSE1	YGL238W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	CYC3	P06182	269 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	CLB4	P24871	460 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	NUP2	P32499	720 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	TFC3	P34111	1160 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	DUG2	P38149	878 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	NDT80	P38830	627 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	GAB1	P41733	394 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	AAD10	P47182	288 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	AVT4	P50944	713 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	RCO1	Q04779	684 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	PHO92	Q06390	306 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YPS3	Q12303	508 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	NUP159	P40477	1460 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	PDR12	Q02785	1511 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	NFT1	P0CE68	1218 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	BUB3	P26449	341 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	HCS1	P34243	683 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YKL050C	P35736	922 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	DTR1	P38125	572 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	SPO73	P40031	143 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	PRM5	P40476	318 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	AIM22	P47051	409 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	IRC15	Q02733	499 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	COQ9	Q05779	260 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	COX17	Q12287	69 aa		0.46	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	ARG81	P05085	880 aa		0.45	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	MRP4	P32902	394 aa		0.45	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	SDH3	P33421	198 aa		0.45	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
CSE1	YGL238W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34

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