RNA–Protein interactions for RNA: YDR319C

YFT2, Transcript of Protein required for normal ER membrane biosynthesis, yeast

Gene YFT2, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YFT2	YDR319C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YFT2	YDR319C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YFT2	YDR319C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YCR043C	P25361	127 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	SGF29	P25554	259 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	MCM10	P32354	571 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	MIA40	P36046	403 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
YFT2	YDR319C	SGF73	P53165	657 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	BSC5	P53755	489 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	ESBP6	P53918	673 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YKU80	Q04437	629 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	ENT4	Q07872	247 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	BUD7	Q08754	746 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	TAF10	Q12030	206 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	HAP2	P06774	265 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	APE1	P14904	514 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	VPS3	P23643	1011 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	HEL1	P36113	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	FIS1	P40515	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	NNF2	P53253	936 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YNL181W	P53878	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	SKM1	Q12469	655 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	NKP1	Q12493	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	MOT1	P32333	1867 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YKL050C	P35736	922 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	UBP11	P36026	717 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	GAA1	P39012	614 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	BUR6	P40096	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	VRG4	P40107	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	MAF1	P41910	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	EPL1	P43572	832 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	VTC2	P43585	828 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	SHE10	P53075	577 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	RTT102	P53330	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	PGA2	P53903	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YSA1	Q01976	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	PSR1	Q07800	427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	PGS1	P25578	521 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	PEX34	P25584	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	DPH2	P32461	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	COT1	P32798	439 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YPK3	P38070	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	VID24	P38263	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	EFM2	P38347	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	PHO90	P39535	881 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YGL138C	P53122	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	CUL3	P53202	744 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	RET3	P53600	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	RAD30	Q04049	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	COQ9	Q05779	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	NSE1	Q07913	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	PLP2	Q12017	286 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	APL4	Q12028	832 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	RPB8	P20436	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	MET30	P39014	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YIL060W	P40519	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	SAD1	P43589	448 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	BET4	Q00618	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	EKI1	Q03764	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	PDR3	P33200	976 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	GCS1	P35197	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	MRX3	P38172	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	MMS4	P38257	691 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	TSC10	P38342	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	SIP3	P38717	1229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	UBA4	P38820	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YFT2	YDR319C	ELO1	P39540	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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