RNA–Protein interactions for RNA: YBR128C

ATG14, Transcript of Autophagy-specific subunit of phosphatidylinositol 3-kinase complex I, yeast

Gene ATG14, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG14	YBR128C	HRD3	Q05787	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	ATG23	Q06671	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	DDC1	Q08949	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	TGS1	Q12052	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	NMD4	Q12129	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	EMP46	Q12396	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	STE12	P13574	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	SYN8	P31377	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	DBF4	P32325	704 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	SPC110	P32380	944 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	LOT5	P34234	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	RCK2	P38623	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	MUP3	P38734	546 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	TCD1	P38756	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	MIT1	P40002	666 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	SLZ1	P40167	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	ASG1	P40467	964 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	BRO1	P48582	844 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	BUD17	P53727	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	BOP3	P53958	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	NGL3	Q03210	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	USA1	Q03714	838 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	DAS2	Q12084	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	LCB4	Q12246	624 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	JIP3	O13555	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	CBS1	P14066	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	APE1	P14904	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	PUT4	P15380	627 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	STE4	P18851	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	CDC5	P32562	705 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	EMP70	P32802	667 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	HIS2	P38635	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YHR131C	P38835	850 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YER189W	P40104	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	SNZ3	P43545	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	GUF1	P46943	645 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	IMO32	P53219	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	BTN2	P53286	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	SNZ2	P53824	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	GTB1	Q04924	702 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	BSP1	Q06604	576 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	CIR2	Q08822	631 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	TAF10	Q12030	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	RAD10	P06838	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	CNE1	P27825	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	ERG3	P32353	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	SIP1	P32578	815 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	SRB2	P34162	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	DUG2	P38149	878 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	AVT2	P39981	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YIL166C	P40445	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	AXL1	P40851	1208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	CDC1	P40986	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	IME4	P41833	600 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	KAP114	P53067	1004 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	HOP2	P53187	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YGR079W	P53249	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	INN1	P53901	409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YNL144C	P53907	740 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
ATG14	YBR128C	RTN2	Q12443	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG14	YBR128C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	PDX1	P16451	410 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	PET123	P17558	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	CKI1	P20485	582 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	POL4	P25615	582 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	SRB5	P32585	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	MUM2	P38236	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	RRT2	P38332	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	MTG2	P38860	518 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	UBX6	P47049	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	GLO1	P50107	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	YNR061C	P53747	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	PIR3	Q03180	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	RCF1	Q03713	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	AIM32	Q04689	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG14	YBR128C	TAF9	Q05027	157 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.1 ms