RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493854.5

RABGAP1-212, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGAP1, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-212ENST00000493854 RASSF7Q02833 373 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 TEFQ10587 303 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 HYAL2Q12891 473 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 KCTD2Q14681 263 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 GJA10Q969M2 543 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 NXPE3Q969Y0 559 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 CFAP53Q96M91 514 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 SCLT1Q96NL6 688 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 KLF15Q9UIH9 416 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 KCPQ6ZWJ8 1503 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 COL15A1P39059 1388 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ERC2O15083 957 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 STARD3NLO95772 234 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ASLP04424 464 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ACRP10323 421 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 BPIP17213 487 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 SERPINB3P29508 390 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 CHRNA5P30532 468 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PRKAR2BP31323 418 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 COPB2P35606 906 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 SOX18P35713 384 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 EMP3P54852 163 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 GTF2H3Q13889 308 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PTPN21Q16825 1174 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 SV2CQ496J9 727 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 CEP120Q8N960 986 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 IL17REQ8NFR9 667 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 COG1Q8WTW3 980 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 BRD7Q9NPI1 651 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PIM2Q9P1W9 311 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 NARFQ9UHQ1 456 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 NUDCQ9Y266 331 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 UBR2Q8IWV8 1755 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PCNTO95613 3336 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PRRT4C9JH25 899 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 APAF1O14727 1248 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 OPA1O60313 960 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 HTR3BO95264 441 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PGRP06401 933 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PYGMP11217 842 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ACPPP15309 386 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 TYRP1P17643 537 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 KCNA3P22001 575 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 CCND1P24385 295 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 TM4SF1P30408 202 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 CYP2C19P33261 490 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 FLT3P36888 993 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 GJA9P57773 515 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 CCINQ13939 588 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 NFIXQ14938 502 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 GNPTABQ3T906 1256 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ZNF790Q6PG37 636 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 CBX8Q9HC52 389 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 GMIPQ9P107 970 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 ZFATQ9P243 1243 aa7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RABGAP1-212ENST00000493854 A0A087WZG4 1122 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGAP1-212ENST00000493854 A0A1W2PNR3 127 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGAP1-212ENST00000493854 RNF223E7ERA6 249 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGAP1-212ENST00000493854 NEMP1O14524 444 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGAP1-212ENST00000493854 TNFRSF10CO14798 259 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms