RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445150.3

SRP19-202, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP19, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-202ENST00000445150 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.22■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.22■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 WASF1Q92558 559 aa20.22■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 PHKBQ93100 1093 aa20.22■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 MYH6P13533 1939 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 CAPN15O75808 1086 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 RARBP10826 455 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 GNA11P29992 359 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 ME3Q16798 604 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 BICD2Q8TD16 824 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 C6orf50Q9HD87 102 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 PXMP2Q9NR77 195 aa20.21■□□□□ 0.83
SRP19-202ENST00000445150 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 ESYT2A0FGR8 921 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 SMCO2A6NFE2 343 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 STXBP3O00186 592 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 EDNRBP24530 442 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 ADCY7P51828 1080 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 IFFO2Q5TF58 517 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 TRPV1Q8NER1 839 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 GTF3C6Q969F1 213 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 SPC25Q9HBM1 224 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.2■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 POTEFA5A3E0 1075 aa20.19■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 STAM2O75886 525 aa20.19■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 NR3C2P08235 984 aa20.19■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.19■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 COL20A1Q9P218 1284 aa20.19■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 STK36Q9NRP7 1315 aa20.19■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 MEIS2O14770 477 aa20.18■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 CCND2P30279 289 aa20.18■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 PKN1Q16512 942 aa20.18■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.18■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 LHX8Q68G74 356 aa20.18■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.18■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 ASTN1O14525 1302 aa20.18■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 TNFAIP2Q03169 654 aa20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 AP3B2Q13367 1082 aa20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 GALNT17Q6IS24 598 aa20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 NECAB1Q8N987 351 aa20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 SCFD2Q8WU76 684 aa20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 Q9Y3F1 56 aa20.17■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 RGS19P49795 217 aa20.16■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 NLRP5P59047 1200 aa20.16■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 PGM5Q15124 567 aa20.16■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.16■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 RNF180Q86T96 592 aa20.16■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.16■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 KATNBL1Q9H079 304 aa20.16■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.16■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.15■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 TTLL4Q14679 1199 aa20.15■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 GNPTABQ3T906 1256 aa20.15■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.15■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.15■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.15■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.15■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.15■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SRP19-202ENST00000445150 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.14■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 KBTBD13C9JR72 458 aa20.14■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.14■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.14■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 DNM1LO00429 736 aa20.13■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 PPFIA3O75145 1194 aa20.13■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 LARGE1O95461 756 aa20.13■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 TGFB3P10600 412 aa20.13■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.13■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 TRIM29Q14134 588 aa20.13■□□□□ 0.81
SRP19-202ENST00000445150 UBE2SQ16763 222 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms