RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C NUP192P47054 1683 aa8.14□□□□□ -1.11
RRP4YHR069C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.13□□□□□ -1.11not detected
RRP4YHR069C AI2P03876 854 aa8.1□□□□□ -1.11
RRP4YHR069C RTC1Q08281 1341 aa8.09□□□□□ -1.11
RRP4YHR069C PAF1P38351 445 aa8.09□□□□□ -1.11
RRP4YHR069C EPS1P40557 701 aa8.09□□□□□ -1.11
RRP4YHR069C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RRP4YHR069C YFR006WP43590 535 aa8.06□□□□□ -1.12
RRP4YHR069C NOP7P53261 605 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RRP4YHR069C BDF1P35817 686 aa8.04□□□□□ -1.12
RRP4YHR069C BCK1Q01389 1478 aa8.04□□□□□ -1.12
RRP4YHR069C BBC1P47068 1157 aa8.03□□□□□ -1.12
RRP4YHR069C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RRP4YHR069C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RRP4YHR069C RAD9P14737 1309 aa8.01□□□□□ -1.13
RRP4YHR069C KRE5P22023 1365 aa8□□□□□ -1.13
RRP4YHR069C ALD4P46367 519 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RRP4YHR069C SLX5P32828 619 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RRP4YHR069C MGA2P40578 1113 aa7.98□□□□□ -1.13
RRP4YHR069C CST9Q06032 482 aa7.98□□□□□ -1.13
RRP4YHR069C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RRP4YHR069C CAB1Q04430 367 aa7.96□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C TAF5P38129 798 aa7.95□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C YMR196WQ04336 1088 aa7.95□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C ESL2P36168 1195 aa7.94□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C THI12P42883 340 aa7.94□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C THI5P43534 340 aa7.94□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C THI11P47183 340 aa7.94□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C RIA1P53893 1110 aa7.94□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C THI13Q07748 340 aa7.94□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C MRX12P47084 519 aa7.93□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C TAF8Q03750 510 aa7.9□□□□□ -1.14
RRP4YHR069C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RRP4YHR069C KIP3P53086 805 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RRP4YHR069C SPE2P21182 396 aa7.85□□□□□ -1.15
RRP4YHR069C MRM1P25270 412 aa7.85□□□□□ -1.15
RRP4YHR069C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
RRP4YHR069C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RRP4YHR069C PPH3P32345 308 aa7.81□□□□□ -1.16
RRP4YHR069C RCM1P53972 490 aa7.81□□□□□ -1.16
RRP4YHR069C NAP1P25293 417 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RRP4YHR069C POL5P39985 1022 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RRP4YHR069C CPS1P27614 576 aa7.79□□□□□ -1.16
RRP4YHR069C TY4B-HP0C2J7 1802 aa7.78□□□□□ -1.16
RRP4YHR069C TY4B-JP47024 1803 aa7.78□□□□□ -1.16
RRP4YHR069C TGL3P40308 642 aa7.78□□□□□ -1.16
RRP4YHR069C PSK1P31374 1356 aa7.78□□□□□ -1.16
RRP4YHR069C YML133CQ03099 1374 aa7.76□□□□□ -1.17
RRP4YHR069C YLL067CQ07888 1374 aa7.76□□□□□ -1.17
RRP4YHR069C YLL066CQ99208 1374 aa7.76□□□□□ -1.17
RRP4YHR069C CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RRP4YHR069C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RRP4YHR069C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RRP4YHR069C MHP1P43638 1398 aa7.74□□□□□ -1.17
RRP4YHR069C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RRP4YHR069C RCR1P38212 213 aa7.73□□□□□ -1.17
RRP4YHR069C DMA1P38823 416 aa7.71□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C FKH1P40466 484 aa7.71□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C RTG3P38165 486 aa7.7□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C YIL177CP40434 1758 aa7.69□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C YJL225CP40889 1758 aa7.69□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C YRF1-2P40105 1681 aa7.68□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C PRP43P53131 767 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C PDS5Q04264 1277 aa7.68□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C SCT1P32784 759 aa7.67□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C VPS29P38759 282 aa7.66□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C APP1P53933 587 aa7.66□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C RAM2P29703 316 aa7.65□□□□□ -1.18
RRP4YHR069C NST1P53935 1240 aa7.64□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C ENT1Q12518 454 aa7.63□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C PRP5P21372 849 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.62□□□□□ -1.19not detected
RRP4YHR069C CSE4P36012 229 aa7.62□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C URB1P34241 1764 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C AUS1Q08409 1394 aa7.6□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C ENV9Q08651 330 aa7.6□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C YRF1-3P0CX14 1859 aa7.6□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C YRF1-7P0CX15 1859 aa7.6□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C YRF1-6P53819 1859 aa7.6□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C YAP5P40574 245 aa7.59□□□□□ -1.19
RRP4YHR069C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.59□□□□□ -1.19not detected
RRP4YHR069C FKS3Q04952 1785 aa7.59□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C TAP42Q04372 366 aa7.58□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C YOR238WQ08634 303 aa7.58□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C SPT7P35177 1332 aa7.57□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C PDI1P17967 522 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C STS1P38637 319 aa7.57□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C PIB1Q06651 286 aa7.57□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C SLM3Q12093 417 aa7.57□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C APC1P53886 1748 aa7.57□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RRP4YHR069C HIM1Q06674 414 aa7.56□□□□□ -1.2
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