RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W-A

YBL008W-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YBL008W-A, Length 240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-MR2P0CX69 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A GCD11P32481 527 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A NPL4P33755 580 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-JR2P47099 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-DR1Q03856 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-BRQ12217 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-NL2Q12470 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-GR2Q12485 440 aa6.52□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A SEC2P17065 759 aa6.51□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A TFB4Q12004 338 aa6.49□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A ASH1P34233 588 aa6.47□□□□□ -1.37
YBL008W-AYBL008W-A CSC1Q06538 782 aa6.46□□□□□ -1.38
YBL008W-AYBL008W-A RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
YBL008W-AYBL008W-A RRN7P40992 514 aa6.44□□□□□ -1.38
YBL008W-AYBL008W-A MET32Q12041 191 aa6.44□□□□□ -1.38
YBL008W-AYBL008W-A AFT1P22149 690 aa6.42□□□□□ -1.38
YBL008W-AYBL008W-A YDR090CQ03193 310 aa6.42□□□□□ -1.38
YBL008W-AYBL008W-A PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
YBL008W-AYBL008W-A KIC1P38692 1080 aa6.4□□□□□ -1.38
YBL008W-AYBL008W-A HST3P53687 447 aa6.4□□□□□ -1.38
YBL008W-AYBL008W-A SET1P38827 1080 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
YBL008W-AYBL008W-A YJR115WP47152 169 aa6.35□□□□□ -1.39
YBL008W-AYBL008W-A CAF120P53836 1060 aa6.35□□□□□ -1.39
YBL008W-AYBL008W-A TRK2P28584 889 aa6.33□□□□□ -1.4
YBL008W-AYBL008W-A ACO2P39533 789 aa6.32□□□□□ -1.4
YBL008W-AYBL008W-A ORC6P38826 435 aa6.3□□□□□ -1.4
YBL008W-AYBL008W-A MOD5P07884 428 aa6.28□□□□□ -1.4
YBL008W-AYBL008W-A IFH1P39520 1085 aa6.28□□□□□ -1.4
YBL008W-AYBL008W-A PUS5Q06244 254 aa6.28□□□□□ -1.4
YBL008W-AYBL008W-A YGR035CP53222 116 aa6.27□□□□□ -1.41
YBL008W-AYBL008W-A MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YBL008W-AYBL008W-A PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
YBL008W-AYBL008W-A YPR109WQ06104 294 aa6.23□□□□□ -1.41
YBL008W-AYBL008W-A ERF2Q06551 359 aa6.23□□□□□ -1.41
YBL008W-AYBL008W-A KEX2P13134 814 aa6.22□□□□□ -1.41
YBL008W-AYBL008W-A OPT2Q06593 877 aa6.21□□□□□ -1.42
YBL008W-AYBL008W-A HPF1Q05164 967 aa6.2□□□□□ -1.42
YBL008W-AYBL008W-A MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
YBL008W-AYBL008W-A YLR346CQ06139 101 aa6.17□□□□□ -1.42
YBL008W-AYBL008W-A RGR1P19263 1082 aa6.16□□□□□ -1.42
YBL008W-AYBL008W-A YIR007WP40566 764 aa6.16□□□□□ -1.42
YBL008W-AYBL008W-A LSB3P43603 459 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
YBL008W-AYBL008W-A ICP55P40051 511 aa6.15□□□□□ -1.42
YBL008W-AYBL008W-A REF2P42073 533 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
YBL008W-AYBL008W-A PTK2P47116 818 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
YBL008W-AYBL008W-A AGE1Q04412 482 aa6.13□□□□□ -1.43
YBL008W-AYBL008W-A GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
YBL008W-AYBL008W-A TUB4P53378 473 aa6.12□□□□□ -1.43
YBL008W-AYBL008W-A PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
YBL008W-AYBL008W-A UGA3P26370 528 aa6.1□□□□□ -1.43
YBL008W-AYBL008W-A SRF1Q12516 437 aa6.1□□□□□ -1.43
YBL008W-AYBL008W-A YPR204WQ08995 1032 aa6.09□□□□□ -1.43
YBL008W-AYBL008W-A SCW11P53189 542 aa6.08□□□□□ -1.44
YBL008W-AYBL008W-A NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data6.08□□□□□ -1.44not detected
YBL008W-AYBL008W-A SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-BLQ12266 440 aa6.06□□□□□ -1.44
YBL008W-AYBL008W-A NUP85P46673 744 aa6.05□□□□□ -1.44
YBL008W-AYBL008W-A COX6P00427 148 aa6.04□□□□□ -1.44
YBL008W-AYBL008W-A TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
YBL008W-AYBL008W-A MIP1P15801 1254 aa6.03□□□□□ -1.44
YBL008W-AYBL008W-A TPD3P31383 635 aa6.02□□□□□ -1.45
YBL008W-AYBL008W-A MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
YBL008W-AYBL008W-A KXD1P53158 218 aa6□□□□□ -1.45
YBL008W-AYBL008W-A PHM7Q12252 991 aa6□□□□□ -1.45
YBL008W-AYBL008W-A HXT10P43581 546 aa5.98□□□□□ -1.45
YBL008W-AYBL008W-A MDJ1P35191 511 aa5.97□□□□□ -1.45
YBL008W-AYBL008W-A RTF1P53064 558 aa5.97□□□□□ -1.45
YBL008W-AYBL008W-A DPH6Q12429 685 aa5.97□□□□□ -1.45
YBL008W-AYBL008W-A YPR148CQ06523 435 aa5.96□□□□□ -1.46
YBL008W-AYBL008W-A YNL115CP53925 644 aa5.94□□□□□ -1.46
YBL008W-AYBL008W-A PDC1P06169 563 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
YBL008W-AYBL008W-A MRT4P33201 236 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
YBL008W-AYBL008W-A UBP2Q01476 1272 aa5.91□□□□□ -1.46
YBL008W-AYBL008W-A KIP2P28743 706 aa5.9□□□□□ -1.46
YBL008W-AYBL008W-A RTT106P40161 455 aa5.9□□□□□ -1.46
YBL008W-AYBL008W-A LSC2P53312 427 aa5.9□□□□□ -1.46
YBL008W-AYBL008W-A ROG3P43602 733 aa5.89□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A CLB5P30283 435 aa5.88□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A IXR1P33417 597 aa5.87□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A NSG2P53898 299 aa5.87□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A TY1A-MR1Q04215 440 aa5.87□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A PSE1P32337 1089 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A LYS5P50113 272 aa5.86□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A CCP1P00431 361 aa5.85□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A ARG82P07250 355 aa5.85□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A SIT4P20604 311 aa5.84□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A AAD14P42884 376 aa5.84□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A TCB1Q12466 1186 aa5.84□□□□□ -1.47
YBL008W-AYBL008W-A JJJ3P47138 172 aa5.83□□□□□ -1.48
YBL008W-AYBL008W-A YJR098CP47139 656 aa5.83□□□□□ -1.48
YBL008W-AYBL008W-A VPS70P47161 811 aa5.83□□□□□ -1.48
YBL008W-AYBL008W-A OSH7P38755 437 aa5.82□□□□□ -1.48
YBL008W-AYBL008W-A DLD1P32891 587 aa5.8□□□□□ -1.48
YBL008W-AYBL008W-A THI72Q08579 599 aa5.8□□□□□ -1.48
YBL008W-AYBL008W-A YFL066CP43538 392 aa5.79□□□□□ -1.48
YBL008W-AYBL008W-A ALR1Q08269 859 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.2 ms