RNA–Protein interactions for RNA: tC(GCA)B

tC(GCA)B, Transcript of Cysteine tRNA (tRNA-Cys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tC(GCA)B, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tC(GCA)BtC(GCA)B ACO2P39533 789 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SAW1P39735 261 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PRM2P40534 656 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SEC27P41811 889 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B CIR1P42940 261 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YFL051CP43552 160 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B TAH11P47112 604 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B KXD1P53158 218 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B EFM6P53970 246 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B EBS1Q03466 884 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YMR210WQ03649 449 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B EFR3Q03653 782 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B GIS1Q03833 894 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B RPN9Q04062 393 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B VPS20Q04272 221 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B VMS1Q04311 632 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ATG9Q12142 997 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B UPC2Q12151 913 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PST1Q12355 444 aa2.98□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B HXK2P04807 486 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B DAP2P18962 818 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YCK1P23291 538 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ADE1P27616 306 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B MLS1P30952 554 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B MRPS5P33759 307 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B RRN10P38204 145 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B NCL1P38205 684 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B ICS2P38284 255 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YMR262WP38430 313 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B INM1P38710 295 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B BCD1P38772 366 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B SEN34P39707 275 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B FLC2P39719 783 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YER188WP40103 239 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B TIM54P47045 478 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B EMC2P47133 292 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B STE24P47154 453 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YGR067CP53243 804 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YGR111WP53265 400 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YNR040WP53736 256 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B MTQ1P53944 314 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B MRL1Q06815 381 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B NRT1Q08485 598 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B MCH5Q08777 521 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B LDB17Q12342 491 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B YOR012WQ12351 137 aa2.97□□□□□ -1.93
tC(GCA)BtC(GCA)B PRT1P06103 763 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B YAR066WP0CX18 203 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B YHR214WP0CX19 203 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B CLB1P24868 471 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B YCR099CP25657 155 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B APT2P36973 181 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B ECM2P38241 364 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B PRS3P38689 320 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B CIN1P40987 1014 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B MNN5P46982 586 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B ROG1P53118 685 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B UBX4P54730 416 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B RLI1Q03195 608 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B TRS31Q03337 283 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B GAS3Q03655 524 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B TDA9Q04545 1251 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B BOP2Q06150 570 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B PML1Q07930 204 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B RMD5Q12508 421 aa2.96□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B RPL15AP05748 204 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B CDC21P06785 304 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B COR1P07256 457 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B PCT1P13259 424 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B ARG1P22768 420 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B PHO3P24031 467 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B ERG1P32476 496 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B SUI1P32911 108 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B TIP20P33891 701 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B LRG1P35688 1017 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B RRN3P36070 627 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B YHL037CP38733 133 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B HSE1P38753 452 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B NEO1P40527 1151 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B PKP1P40530 394 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B MMM1P41800 426 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B PRY1P47032 299 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B YGR250CP53316 781 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B NOG2P53742 486 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B YNR068CP53754 272 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B ERG5P54781 538 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B SLU7Q02775 382 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B API2Q04413 109 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B NUT2Q06213 157 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B YLR040CQ07988 224 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B SPO24Q3E752 67 aa2.95□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.94□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B CDC36P06100 191 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B MET2P08465 486 aa2.94□□□□□ -1.94
tC(GCA)BtC(GCA)B YCK2P23292 546 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
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