RNA–Protein interactions for RNA: YLR356W

ATG33, Transcript of Mitochondrial mitophagy-specific protein, yeast

Gene ATG33, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG33	YLR356W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YCL068C	P25593	260 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	KIP2	P28743	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	KKQ8	P36004	724 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	SEA4	P38164	1038 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	RKM3	P38222	552 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YHR112C	P38716	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MEP1	P40260	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MNT3	P40549	630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	DJP1	P40564	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	BAP3	P41815	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YFL012W	P43580	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	OSW7	P43611	510 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	RIM8	P53179	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YGR015C	P53208	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	HOL1	P53389	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	ATG29	Q12092	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	ICT1	Q12385	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	ATP12	P22135	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CLB1	P24868	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	STP22	P25604	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CDC20	P26309	610 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	BUD14	P27637	709 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	KRE6	P32486	720 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	ATO2	P32907	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YBR139W	P38109	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MSG5	P38590	489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YEL057C	P39983	233 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	NDE1	P40215	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	HOC1	P47124	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YJR149W	P47177	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	TIS11	P47977	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	BSC5	P53755	489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	NUP53	Q03790	475 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	XYL2	Q07993	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	APL4	Q12028	832 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CDC21	P06785	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	SRB4	P32569	687 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	BEM3	P32873	1128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	INM1	P38710	295 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YHI9	P38765	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	GID8	P40208	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	ENT4	Q07872	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MMT2	Q08970	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	GLO4	Q12320	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YMC1	P32331	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	PEX5	P35056	612 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MCM7	P38132	845 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	RRN10	P38204	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	MET30	P39014	640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	HAT2	P39984	401 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	RTA1	P53047	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	ATG4	P53867	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	VPS38	Q05919	439 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	HER1	Q12276	1246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	STE3	P06783	470 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	URA10	P30402	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YEL020C	P39994	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	PMT4	P46971	762 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	TIM54	P47045	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	BIO3	P50277	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	RPN14	P53196	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	ALF1	P53904	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	CDC123	Q05791	360 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATG33	YLR356W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
ATG33	YLR356W	SPC42	P36094	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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