RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A SLD5Q03406 294 aa2.28□□□□□ -2.04
YHL009W-AYHL009W-A YDL009CQ12210 107 aa2.28□□□□□ -2.04
YHL009W-AYHL009W-A RBD2Q12270 262 aa2.28□□□□□ -2.04
YHL009W-AYHL009W-A ERV2Q12284 196 aa2.28□□□□□ -2.04
YHL009W-AYHL009W-A SPE4Q12455 300 aa2.28□□□□□ -2.04
YHL009W-AYHL009W-A RAD52P06778 471 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A ARD1P07347 238 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A PEP5P12868 1029 aa2.27□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A KAR3P17119 729 aa2.27□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A RNA14P25298 677 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YKL100CP34248 587 aa2.27□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A UTH1P36135 365 aa2.27□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YSA1Q01976 231 aa2.27□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A SHR3Q02774 210 aa2.27□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YDL057WQ07379 328 aa2.27□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YOR365CQ08844 703 aa2.27□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A ADH2P00331 348 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A SUC2P00724 532 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A LPD1P09624 499 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A MRP13P12686 339 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A SGF29P25554 259 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A IMG1P25626 169 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A UBP11P36026 717 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A RRN3P36070 627 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A TPM2P40414 161 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YIL067CP40514 678 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A PTR3P43606 678 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A SHY1P53266 389 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A ATG16Q03818 150 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A TCO89Q08921 799 aa2.26□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A PEP4P07267 405 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A RVS161P25343 265 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A ELO2P25358 347 aa2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A BOS1P25385 244 aa2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A POL4P25615 582 aa2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A ARO2P28777 376 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A MRS6P32864 603 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A MRP4P32902 394 aa2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YBR144CP34215 104 aa2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A ICS2P38284 255 aa2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A APT1P49435 187 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YML131WQ03102 365 aa2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YCK1P23291 538 aa2.24□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A SSE2P32590 693 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YKL023WP36103 277 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A KAP123P40069 1113 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YFL067WP43537 175 aa2.24□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A ARC1P46672 376 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A ALT2P52892 507 aa2.24□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YGR126WP53274 230 aa2.24□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A COQ9Q05779 260 aa2.24□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A PHO92Q06390 306 aa2.24□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A NBP2Q12163 236 aa2.24□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A CHS1P08004 1131 aa2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YHR210CP38893 341 aa2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A LYS14P40971 790 aa2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YJR154WP47181 346 aa2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A HAL1Q01766 294 aa2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YMR027WQ04371 470 aa2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A MRPL35Q06678 367 aa2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A SDH5Q08230 162 aa2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A SSP2Q08646 371 aa2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A RKM5Q12367 367 aa2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A MF(ALPHA)1P01149 165 aa2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A CDC24P11433 854 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A PCL1P24867 279 aa2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A HCS1P34243 683 aa2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A MRP21P38175 177 aa2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A FUI1P38196 639 aa2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A KEL1P38853 1164 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A FAR3P46671 204 aa2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A IRC15Q02733 499 aa2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A NGL3Q03210 505 aa2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YML037CQ03703 340 aa2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YKU80Q04437 629 aa2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A IVY1Q04934 453 aa2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A ETT1Q08421 412 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
YHL009W-AYHL009W-A YCR007CP25354 239 aa2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A UTR4P32626 227 aa2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A SGS1P35187 1447 aa2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A DUG2P38149 878 aa2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A CCT6P39079 546 aa2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A TIF4631P39935 952 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A GWT1P47026 490 aa2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A AIM22P47051 409 aa2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A MEP3P53390 489 aa2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A BSC5P53755 489 aa2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A BUD22Q04347 519 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A SKM1Q12469 655 aa2.21□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A ART10P18634 518 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A YIH1P25637 258 aa2.2□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A MID2P36027 376 aa2.2□□□□□ -2.06
YHL009W-AYHL009W-A VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
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