RNA–Protein interactions for RNA: YGR209C

TRX2, Transcript of Cytoplasmic thioredoxin isoenzyme, yeast

Gene TRX2, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRX2	YGR209C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	OCA4	P25366	362 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	FUN30	P31380	1131 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	LIP5	P32875	414 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	SCD5	P34758	872 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	MRPL17	P36528	281 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YBR285W	P38354	144 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YHR218W	P38899	603 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	FAD1	P38913	306 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RBG1	P39729	369 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	EXO1	P39875	702 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RIC1	P40395	1056 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YNR068C	P53754	272 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	CAF120	P53836	1060 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YNL143C	P53908	130 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	DMA2	P53924	522 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	ORC3	P54790	616 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	ARP4	P80428	489 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	IRC15	Q02733	499 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RAD33	Q04231	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	PEX12	Q04370	399 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	BSP1	Q06604	576 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RSA1	Q08932	381 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	HUA2	Q12134	243 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	MSH5	Q12175	901 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	IES3	Q12345	250 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	GTT2	Q12390	233 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	ARG3	P05150	338 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	DAL81	P21657	970 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	MNE1	P24720	663 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	TIP20	P33891	701 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	LRG1	P35688	1017 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	LHS1	P36016	881 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	ALY1	P36117	915 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	UBA4	P38820	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RPH1	P39956	796 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	IRR1	P40541	1150 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	MSS2	P40990	351 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	ELP2	P42935	788 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	AMA1	P50082	593 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	KEL2	P50090	882 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	AIM14	P53109	570 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
TRX2	YGR209C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	TRM12	Q04235	462 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	FMP42	Q04991	504 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	BCH1	Q05029	724 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	VTA1	Q06263	330 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	LOT6	Q07923	191 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	NDD1	Q08887	554 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	TGL5	Q12043	749 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	WTM2	Q12206	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	JLP1	Q12358	412 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRX2	YGR209C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	AI3	P03877	415 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	RAP1	P11938	827 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	CLB2	P24869	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	RAD51	P25454	400 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	GEX1	P25596	615 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	SYN8	P31377	255 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	SPC34	P36131	295 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	GEX2	P36173	615 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	YBR138C	P38277	524 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	HSE1	P38753	452 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	EMP65	P40085	556 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	GAB1	P41733	394 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRX2	YGR209C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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