RNA–Protein interactions for RNA: YDR365C

ESF1, Transcript of Nucleolar protein involved in pre-rRNA processing, yeast

Gene ESF1, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ESF1	YDR365C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	CMC1	P36064	111 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	GLG1	P36143	616 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	RCY1	P39531	840 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	SNL1	P40548	159 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	PET130	P47065	347 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	YGL185C	P53100	379 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	YGR066C	P53242	292 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	SLT2	Q00772	484 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	COA4	Q05809	96 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	VPS38	Q05919	439 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	LOT6	Q07923	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	PSK1	P31374	1356 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	KSS1	P14681	368 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	ALG1	P16661	449 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	DBF2	P22204	572 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	YSC84	P32793	468 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	YKL070W	P36087	169 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	MRPL17	P36528	281 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	EHT1	P38295	451 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	BZZ1	P38822	633 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	SSO2	P39926	295 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	JLP2	P40206	208 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	LIF1	P53150	421 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	SDH1	Q00711	640 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	SEC10	Q06245	871 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	UIP4	Q08926	304 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	VIK1	Q12045	647 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	SEY1	Q99287	776 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ESF1	YDR365C	HIP1	P06775	603 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	KIN3	P22209	435 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	MRPL8	P22353	238 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	SDH8	P38345	138 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	FKH1	P40466	484 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	AGE2	P40529	298 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	MSS2	P40990	351 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	SSY5	P47002	699 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	MRM2	P53123	320 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	MAL13	P53338	473 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	CSI1	Q04368	295 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	SMA2	Q04658	369 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	DXO1	Q06349	442 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	NUS1	Q12063	375 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	ARP6	Q12509	438 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	RAD61	Q99359	647 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	LAM4	P38800	1345 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	HIR3	P47171	1648 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	SIR3	P06701	978 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	ARG82	P07250	355 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	FBP1	P09201	348 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	CKA2	P19454	339 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	CNA1	P23287	553 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	RDS1	P25611	832 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	MRPL4	P36517	319 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	RIP-Chip
ESF1	YDR365C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	YTA12	P40341	825 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	BNA6	P43619	295 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	CTK2	P46962	323 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	YJR054W	P47114	497 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	CLA4	P48562	842 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	TWF1	P53250	332 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	GOR1	P53839	350 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	ATG23	Q06671	453 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	CBP1	P07252	654 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ESF1	YDR365C	CKI1	P20485	582 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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