RNA–Protein interactions for RNA: YBL018C

POP8, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP8, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP8	YBL018C	ECM15	P35195	104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	JNM1	P36224	373 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SAD1	P43589	448 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	ALT2	P52892	507 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	CUL3	P53202	744 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	GRS2	Q06817	618 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	THP1	Q08231	455 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	GRX6	Q12438	231 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SUC2	P00724	532 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	GPI10	P30777	616 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	TRS65	P32893	560 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	RIM2	P38127	377 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	VID24	P38263	362 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	STB2	P46679	850 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	ATG29	Q12092	213 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SEC39	Q12745	709 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	COR1	P07256	457 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	PPZ1	P26570	692 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	VPS17	P32913	551 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	MSN2	P33748	704 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	BNA4	P38169	460 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	YTA12	P40341	825 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SRB7	P47822	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	TWF1	P53250	332 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	GLO2	Q05584	274 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	NDD1	Q08887	554 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	RIM20	Q12033	661 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	RED1	P14291	827 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	APE1	P14904	514 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SEC62	P21825	274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	ERG3	P32353	365 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SEC66	P33754	206 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	CMC1	P36064	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	CSM2	P40465	213 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
POP8	YBL018C	SLG1	P54867	378 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	YEH2	Q07950	538 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	NRT1	Q08485	598 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	RTN2	Q12443	393 aa		4.05	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	MRS3	P10566	314 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	PMT1	P33775	817 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	DUG2	P38149	878 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SMF1	P38925	575 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	MBB1	P39534	108 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	VPS52	P39904	641 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	YJL070C	P40361	888 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	YJL068C	P40363	299 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	YGL082W	P53155	381 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SLD5	Q03406	294 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	TAP42	Q04372	366 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	BNA5	Q05979	453 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	DAP1	Q12091	152 aa		4.04	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	RAV1	P47104	1357 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	YCR007C	P25354	239 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	GCS1	P35197	352 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	MEP2	P41948	499 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	HXT14	P42833	540 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	IVY1	Q04934	453 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	SCM3	Q12334	223 aa		4.03	□□□□□ -1.76
POP8	YBL018C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	UTR4	P32626	227 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	FRE1	P32791	686 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	NPL6	P32832	435 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	YAT2	P40017	923 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	IKS1	P47042	667 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	SCS3	P53012	380 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	PHO92	Q06390	306 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.02	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	YUR1	P26725	428 aa		4.01	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	BUD14	P27637	709 aa		4.01	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	ATP11	P32453	318 aa		4.01	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	RTT107	P38850	1070 aa		4.01	□□□□□ -1.77
POP8	YBL018C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77

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