RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546102.1

CUL3-215, Transcript of cullin 3, human

TSL 4

Gene CUL3, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL3-215	ENST00000546102	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	RNF180	Q86T96	592 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	AGL	P35573	1532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CLTCL1	P53675	1640 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	KIF3B	O15066	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ACR	P10323	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PML	P29590	882 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	MLEC	Q14165	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	GMIP	Q9P107	970 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PTPRT	O14522	1441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	TSPAN6	O43657	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	DNAJA2	O60884	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	RFPL3	O75679	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PLCG1	P19174	1290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ITIH2	P19823	946 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CCNF	P41002	786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	EPHB1	P54762	984 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	BIRC2	Q13490	618 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	LRRC41	Q15345	812 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ATG4C	Q96DT6	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SLC9A7	Q96T83	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	KIF2C	Q99661	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	CDC6	Q99741	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	KRT82	Q9NSB4	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	LAMC1	P11047	1609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	KIF1B	O60333	1816 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	ADGRB3	O60242	1522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	GFRA2	O00451	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	PLD2	O14939	933 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	KATNA1	O75449	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	RASGRP1	O95267	797 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	INPP5A	Q14642	412 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SV2C	Q496J9	727 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CUL3-215	ENST00000546102	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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