RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.97■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 KIF28PB7ZC32 967 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 IQCF3P0C7M6 154 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 RFC2P35250 354 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 MORC4Q8TE76 937 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 OSBP2Q969R2 916 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXD12-201ENST00000404162 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
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HOXD12-201ENST00000404162 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 NSMFQ6X4W1 530 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 LCHNA4D1U4 455 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 CCER2I3L3R5 266 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 HMMRO75330 724 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 MCCP23508 829 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 RETREG2Q8NC44 543 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 GMCL1Q96IK5 515 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 TET1Q8NFU7 2136 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.94■■□□□ 1.26
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HOXD12-201ENST00000404162 TSPY8P0CW00 308 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 SLC1A4P43007 532 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 TDO2P48775 406 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 KCTD1Q719H9 257 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.92■■□□□ 1.26
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HOXD12-201ENST00000404162 TFAP4Q01664 338 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 APPBP2Q92624 585 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 GPAA1O43292 621 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 PLA2G6O60733 806 aa22.91■■□□□ 1.26
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HOXD12-201ENST00000404162 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXD12-201ENST00000404162 M0R2C6 588 aa22.89■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 BAIAP3O94812 1187 aa22.89■■□□□ 1.25
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HOXD12-201ENST00000404162 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 GJD3Q8N144 294 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 COPS5Q92905 334 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.88■■□□□ 1.25
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HOXD12-201ENST00000404162 GNAT2P19087 354 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB103AP81534 67 aa22.87■■□□□ 1.25
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HOXD12-201ENST00000404162 PDE4BQ07343 736 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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HOXD12-201ENST00000404162 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.87■■□□□ 1.25
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HOXD12-201ENST00000404162 ICAM1P05362 532 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 STX8Q9UNK0 236 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 MTMR7Q9Y216 660 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 NOD1Q9Y239 953 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 A6NJR5 290 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 IL9P15248 144 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 TCTN1Q2MV58 587 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 NMT2O60551 498 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 KPNA6O60684 536 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 CHMP4BP1P59074 171 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD12-201ENST00000404162 PPP2R5BQ15173 497 aa22.84■■□□□ 1.25
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