RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021990.3

Ptdss1-201, Transcript of Phosphatidylserine synthase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptdss1, Length 3,424 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 AtripQ8BMG1 785 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krt222Q8CCX5 294 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 EcsitQ9QZH6 435 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Vmn2r68L7N2B3 851 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 ChkbO55229 394 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lrrc4bP0C192 709 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Snap25P60879 206 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cct6bQ61390 531 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ctnna3Q65CL1 895 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cfap100Q80VN0 613 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Arhgef19Q8BWA8 802 aa16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Myh7bA2AQP0 1941 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 1700003F12RikA2AKE5 210 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Esyt2Q3TZZ7 845 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lzts2Q91YU6 671 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Xrcc4Q924T3 326 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccdc181Q80ZU5 509 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Znf771Q8BJ90 317 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Znf287Q9EQB9 759 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Dnajc21E9Q8D0 531 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Slc2a13Q3UHK1 637 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Herc4Q6PAV2 1057 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lrrc1Q80VQ1 524 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 BC048507Q80ZS7 89 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Haus2Q9CQS9 234 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 TbcbQ9D1E6 244 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Arl6ip4Q9JM93 229 aa16.06■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Etnk2A7MCT6 385 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rsbn1lD3Z0K6 821 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tcp10bE9PYJ0 438 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Znf827Q505G8 1078 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rufy1Q8BIJ7 712 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Dph6Q9CQ28 267 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Mboat4P0C7A3 435 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 AsnsQ61024 561 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krt87Q6IMF0 495 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rexo1Q7TT28 1213 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Stx17Q9D0I4 301 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ndst4Q9EQW8 872 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Scgb2b19J3QM75 112 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Kif3cO35066 796 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Kcnb1Q03717 857 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ica1lQ3TY65 431 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Large2Q5XPT3 690 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sdccag8Q80UF4 717 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Camsap3Q80VC9 1252 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Armcx3Q8BHS6 379 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sash3Q8K352 380 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tmem191cQ9JJB1 302 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Vps33bP59016 617 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tcerg1lQ3B807 590 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Erich4Q3UNU4 136 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gja3Q64448 417 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Prl2c2P04095 224 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Hdhd2Q3UGR5 259 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cep70Q6IQY5 616 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Fam177a1Q8BR63 207 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Taok3Q8BYC6 898 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Asic2Q925H0 512 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Golga5Q9QYE6 729 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tubb2aQ7TMM9 445 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Dclk3Q8BWQ5 790 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Traf3ip3Q8C0G2 513 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rcor2Q8C796 523 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lrit1Q8K099 624 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Smtnl1Q99LM3 459 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tubb2bQ9CWF2 445 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Krt34Q9D646 392 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cwc15Q9JHS9 229 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ankrd35E9Q9D8 996 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Vmn2r71L7N2D8 855 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 NeblQ0II04 452 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccdc148Q6P5U8 527 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ubxn1Q922Y1 297 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 GsdmeQ9Z2D3 512 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Psma7Q9Z2U0 248 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Akr1b1P45376 316 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Serpinb12Q9D7P9 423 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sept14Q9DA97 430 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Aco1P28271 889 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ighmbp2P40694 993 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Meis1Q60954 390 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.1 ms