Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,31■■■■■ 4,04
Sdccag8Q80UF4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Sdccag8Q80UF4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Sdccag8Q80UF4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Sdccag8Q80UF4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Sdccag8Q80UF4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Sdccag8Q80UF4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,9■■■■□ 3,34
Sdccag8Q80UF4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Sdccag8Q80UF4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,42■■■■□ 3,26
Sdccag8Q80UF4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,22■■■■□ 3,23
Sdccag8Q80UF4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Sdccag8Q80UF4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Sdccag8Q80UF4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
Sdccag8Q80UF4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
Sdccag8Q80UF4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Sdccag8Q80UF4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Sdccag8Q80UF4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Sdccag8Q80UF4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Sdccag8Q80UF4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Sdccag8Q80UF4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Sdccag8Q80UF4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Sdccag8Q80UF4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Sdccag8Q80UF4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Sdccag8Q80UF4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Sdccag8Q80UF4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Sdccag8Q80UF4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Sdccag8Q80UF4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,77■■■■□ 3
Sdccag8Q80UF4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Sdccag8Q80UF4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Sdccag8Q80UF4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Sdccag8Q80UF4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Sdccag8Q80UF4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Sdccag8Q80UF4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Sdccag8Q80UF4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Sdccag8Q80UF4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Sdccag8Q80UF4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Sdccag8Q80UF4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,01■■■□□ 2,88
Sdccag8Q80UF4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Sdccag8Q80UF4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
Sdccag8Q80UF4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Sdccag8Q80UF4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Sdccag8Q80UF4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Sdccag8Q80UF4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Sdccag8Q80UF4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Sdccag8Q80UF4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,56■■■□□ 2,8
Sdccag8Q80UF4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Sdccag8Q80UF4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Sdccag8Q80UF4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Sdccag8Q80UF4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Sdccag8Q80UF4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Sdccag8Q80UF4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Sdccag8Q80UF4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Sdccag8Q80UF4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Sdccag8Q80UF4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Sdccag8Q80UF4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Sdccag8Q80UF4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Sdccag8Q80UF4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Sdccag8Q80UF4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Sdccag8Q80UF4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Sdccag8Q80UF4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Sdccag8Q80UF4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Sdccag8Q80UF4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Sdccag8Q80UF4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Sdccag8Q80UF4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Sdccag8Q80UF4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,68■■■□□ 2,66
Sdccag8Q80UF4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Sdccag8Q80UF4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Sdccag8Q80UF4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,58■■■□□ 2,65
Sdccag8Q80UF4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,58■■■□□ 2,65
Sdccag8Q80UF4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Sdccag8Q80UF4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Sdccag8Q80UF4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Sdccag8Q80UF4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Sdccag8Q80UF4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Sdccag8Q80UF4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Sdccag8Q80UF4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Sdccag8Q80UF4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Sdccag8Q80UF4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Sdccag8Q80UF4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Sdccag8Q80UF4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Sdccag8Q80UF4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Sdccag8Q80UF4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Sdccag8Q80UF4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Sdccag8Q80UF4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Sdccag8Q80UF4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Sdccag8Q80UF4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Sdccag8Q80UF4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Sdccag8Q80UF4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Sdccag8Q80UF4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Sdccag8Q80UF4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
Sdccag8Q80UF4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Sdccag8Q80UF4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Sdccag8Q80UF4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Sdccag8Q80UF4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Sdccag8Q80UF4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Sdccag8Q80UF4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Sdccag8Q80UF4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Sdccag8Q80UF4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Sdccag8Q80UF4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Sdccag8Q80UF4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,2 ms