Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0K6

Rsbn1l, MCG120108, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsbn1lD3Z0K6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,19■■■■■ 4,34
Rsbn1lD3Z0K6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
Rsbn1lD3Z0K6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Rsbn1lD3Z0K6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Rsbn1lD3Z0K6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Rsbn1lD3Z0K6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,27■■■■□ 3,56
Rsbn1lD3Z0K6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,13■■■■□ 3,54
Rsbn1lD3Z0K6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,53■■■■□ 3,44
Rsbn1lD3Z0K6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,38■■■■□ 3,41
Rsbn1lD3Z0K6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Rsbn1lD3Z0K6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,34
Rsbn1lD3Z0K6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,57■■■■□ 3,28
Rsbn1lD3Z0K6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Rsbn1lD3Z0K6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,4■■■■□ 3,26
Rsbn1lD3Z0K6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,28■■■■□ 3,24
Rsbn1lD3Z0K6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Rsbn1lD3Z0K6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Rsbn1lD3Z0K6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Rsbn1lD3Z0K6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Rsbn1lD3Z0K6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Rsbn1lD3Z0K6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Rsbn1lD3Z0K6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Rsbn1lD3Z0K6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Rsbn1lD3Z0K6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Rsbn1lD3Z0K6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Rsbn1lD3Z0K6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,53■■■■□ 3,12
Rsbn1lD3Z0K6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Rsbn1lD3Z0K6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Rsbn1lD3Z0K6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,31■■■■□ 3,08
Rsbn1lD3Z0K6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Rsbn1lD3Z0K6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Rsbn1lD3Z0K6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Rsbn1lD3Z0K6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Rsbn1lD3Z0K6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Rsbn1lD3Z0K6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Rsbn1lD3Z0K6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Rsbn1lD3Z0K6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Rsbn1lD3Z0K6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,96
Rsbn1lD3Z0K6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Rsbn1lD3Z0K6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Rsbn1lD3Z0K6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Rsbn1lD3Z0K6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Rsbn1lD3Z0K6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Rsbn1lD3Z0K6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Rsbn1lD3Z0K6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,17■■■□□ 2,9
Rsbn1lD3Z0K6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Rsbn1lD3Z0K6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Rsbn1lD3Z0K6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,06■■■□□ 2,88
Rsbn1lD3Z0K6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Rsbn1lD3Z0K6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Rsbn1lD3Z0K6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Rsbn1lD3Z0K6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Rsbn1lD3Z0K6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Rsbn1lD3Z0K6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,91■■■□□ 2,86
Rsbn1lD3Z0K6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Rsbn1lD3Z0K6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,74■■■□□ 2,83
Rsbn1lD3Z0K6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Rsbn1lD3Z0K6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Rsbn1lD3Z0K6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Rsbn1lD3Z0K6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Rsbn1lD3Z0K6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,53■■■□□ 2,8
Rsbn1lD3Z0K6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Rsbn1lD3Z0K6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Rsbn1lD3Z0K6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Rsbn1lD3Z0K6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Rsbn1lD3Z0K6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Rsbn1lD3Z0K6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Rsbn1lD3Z0K6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,36■■■□□ 2,77
Rsbn1lD3Z0K6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Rsbn1lD3Z0K6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,27■■■□□ 2,76
Rsbn1lD3Z0K6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Rsbn1lD3Z0K6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Rsbn1lD3Z0K6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Rsbn1lD3Z0K6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Rsbn1lD3Z0K6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Rsbn1lD3Z0K6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Rsbn1lD3Z0K6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Rsbn1lD3Z0K6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,95■■■□□ 2,71
Rsbn1lD3Z0K6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,94■■■□□ 2,7
Rsbn1lD3Z0K6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Rsbn1lD3Z0K6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,86■■■□□ 2,69
Rsbn1lD3Z0K6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Rsbn1lD3Z0K6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Rsbn1lD3Z0K6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Rsbn1lD3Z0K6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Rsbn1lD3Z0K6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Rsbn1lD3Z0K6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Rsbn1lD3Z0K6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Rsbn1lD3Z0K6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Rsbn1lD3Z0K6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Rsbn1lD3Z0K6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Rsbn1lD3Z0K6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,53■■■□□ 2,64
Rsbn1lD3Z0K6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Rsbn1lD3Z0K6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Rsbn1lD3Z0K6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Rsbn1lD3Z0K6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Rsbn1lD3Z0K6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms