Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0K6

Rsbn1l, MCG120108, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsbn1lD3Z0K6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
Rsbn1lD3Z0K6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rsbn1lD3Z0K6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Rsbn1lD3Z0K6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Rsbn1lD3Z0K6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rsbn1lD3Z0K6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Rsbn1lD3Z0K6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Rsbn1lD3Z0K6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Rsbn1lD3Z0K6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Rsbn1lD3Z0K6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rsbn1lD3Z0K6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Rsbn1lD3Z0K6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Rsbn1lD3Z0K6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rsbn1lD3Z0K6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Rsbn1lD3Z0K6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Rsbn1lD3Z0K6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rsbn1lD3Z0K6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rsbn1lD3Z0K6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rsbn1lD3Z0K6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rsbn1lD3Z0K6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rsbn1lD3Z0K6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rsbn1lD3Z0K6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rsbn1lD3Z0K6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rsbn1lD3Z0K6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rsbn1lD3Z0K6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rsbn1lD3Z0K6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Rsbn1lD3Z0K6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rsbn1lD3Z0K6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rsbn1lD3Z0K6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rsbn1lD3Z0K6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsbn1lD3Z0K6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rsbn1lD3Z0K6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rsbn1lD3Z0K6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rsbn1lD3Z0K6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rsbn1lD3Z0K6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rsbn1lD3Z0K6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rsbn1lD3Z0K6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rsbn1lD3Z0K6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rsbn1lD3Z0K6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rsbn1lD3Z0K6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rsbn1lD3Z0K6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rsbn1lD3Z0K6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rsbn1lD3Z0K6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsbn1lD3Z0K6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rsbn1lD3Z0K6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Rsbn1lD3Z0K6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rsbn1lD3Z0K6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rsbn1lD3Z0K6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rsbn1lD3Z0K6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rsbn1lD3Z0K6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rsbn1lD3Z0K6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rsbn1lD3Z0K6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rsbn1lD3Z0K6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rsbn1lD3Z0K6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Rsbn1lD3Z0K6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rsbn1lD3Z0K6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Rsbn1lD3Z0K6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rsbn1lD3Z0K6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rsbn1lD3Z0K6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rsbn1lD3Z0K6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rsbn1lD3Z0K6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rsbn1lD3Z0K6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rsbn1lD3Z0K6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rsbn1lD3Z0K6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rsbn1lD3Z0K6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rsbn1lD3Z0K6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rsbn1lD3Z0K6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rsbn1lD3Z0K6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Rsbn1lD3Z0K6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rsbn1lD3Z0K6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Rsbn1lD3Z0K6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rsbn1lD3Z0K6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rsbn1lD3Z0K6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsbn1lD3Z0K6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rsbn1lD3Z0K6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rsbn1lD3Z0K6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rsbn1lD3Z0K6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rsbn1lD3Z0K6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Rsbn1lD3Z0K6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Rsbn1lD3Z0K6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rsbn1lD3Z0K6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Rsbn1lD3Z0K6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Rsbn1lD3Z0K6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rsbn1lD3Z0K6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rsbn1lD3Z0K6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rsbn1lD3Z0K6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rsbn1lD3Z0K6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rsbn1lD3Z0K6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rsbn1lD3Z0K6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rsbn1lD3Z0K6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rsbn1lD3Z0K6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rsbn1lD3Z0K6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Rsbn1lD3Z0K6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rsbn1lD3Z0K6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rsbn1lD3Z0K6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rsbn1lD3Z0K6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rsbn1lD3Z0K6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms