Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Ighmbp2P40694 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ighmbp2P40694 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ighmbp2P40694 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ighmbp2P40694 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ighmbp2P40694 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ighmbp2P40694 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Ighmbp2P40694 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ighmbp2P40694 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ighmbp2P40694 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ighmbp2P40694 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Ighmbp2P40694 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ighmbp2P40694 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Ighmbp2P40694 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ighmbp2P40694 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ighmbp2P40694 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ighmbp2P40694 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ighmbp2P40694 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Ighmbp2P40694 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Ighmbp2P40694 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ighmbp2P40694 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ighmbp2P40694 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ighmbp2P40694 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ighmbp2P40694 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ighmbp2P40694 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ighmbp2P40694 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ighmbp2P40694 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Ighmbp2P40694 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ighmbp2P40694 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ighmbp2P40694 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ighmbp2P40694 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ighmbp2P40694 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ighmbp2P40694 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ighmbp2P40694 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ighmbp2P40694 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ighmbp2P40694 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ighmbp2P40694 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ighmbp2P40694 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ighmbp2P40694 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ighmbp2P40694 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ighmbp2P40694 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ighmbp2P40694 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Ighmbp2P40694 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ighmbp2P40694 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ighmbp2P40694 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ighmbp2P40694 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ighmbp2P40694 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ighmbp2P40694 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ighmbp2P40694 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ighmbp2P40694 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ighmbp2P40694 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ighmbp2P40694 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ighmbp2P40694 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ighmbp2P40694 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ighmbp2P40694 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ighmbp2P40694 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ighmbp2P40694 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ighmbp2P40694 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ighmbp2P40694 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ighmbp2P40694 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ighmbp2P40694 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ighmbp2P40694 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ighmbp2P40694 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ighmbp2P40694 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ighmbp2P40694 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ighmbp2P40694 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ighmbp2P40694 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ighmbp2P40694 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ighmbp2P40694 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ighmbp2P40694 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ighmbp2P40694 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ighmbp2P40694 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ighmbp2P40694 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ighmbp2P40694 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ighmbp2P40694 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ighmbp2P40694 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ighmbp2P40694 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ighmbp2P40694 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ighmbp2P40694 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ighmbp2P40694 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ighmbp2P40694 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ighmbp2P40694 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ighmbp2P40694 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ighmbp2P40694 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ighmbp2P40694 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ighmbp2P40694 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ighmbp2P40694 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ighmbp2P40694 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ighmbp2P40694 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ighmbp2P40694 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ighmbp2P40694 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ighmbp2P40694 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ighmbp2P40694 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ighmbp2P40694 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ighmbp2P40694 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ighmbp2P40694 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ighmbp2P40694 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ighmbp2P40694 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ighmbp2P40694 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ighmbp2P40694 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms