Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,9■■■■□ 3,5
Stx17Q9D0I4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,45
Stx17Q9D0I4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Stx17Q9D0I4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Stx17Q9D0I4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
Stx17Q9D0I4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Stx17Q9D0I4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Stx17Q9D0I4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Stx17Q9D0I4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Stx17Q9D0I4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Stx17Q9D0I4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Stx17Q9D0I4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,08■■■□□ 2,89
Stx17Q9D0I4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Stx17Q9D0I4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Stx17Q9D0I4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Stx17Q9D0I4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Stx17Q9D0I4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,66■■■□□ 2,82
Stx17Q9D0I4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
Stx17Q9D0I4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Stx17Q9D0I4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Stx17Q9D0I4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Stx17Q9D0I4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Stx17Q9D0I4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Stx17Q9D0I4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Stx17Q9D0I4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Stx17Q9D0I4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Stx17Q9D0I4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Stx17Q9D0I4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Stx17Q9D0I4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,64■■■□□ 2,65
Stx17Q9D0I4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Stx17Q9D0I4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Stx17Q9D0I4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Stx17Q9D0I4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Stx17Q9D0I4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Stx17Q9D0I4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Stx17Q9D0I4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Stx17Q9D0I4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Stx17Q9D0I4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Stx17Q9D0I4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Stx17Q9D0I4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Stx17Q9D0I4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Stx17Q9D0I4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Stx17Q9D0I4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Stx17Q9D0I4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Stx17Q9D0I4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Stx17Q9D0I4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Stx17Q9D0I4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Stx17Q9D0I4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Stx17Q9D0I4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Stx17Q9D0I4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Stx17Q9D0I4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Stx17Q9D0I4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Stx17Q9D0I4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,45■■■□□ 2,47
Stx17Q9D0I4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Stx17Q9D0I4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Stx17Q9D0I4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Stx17Q9D0I4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Stx17Q9D0I4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Stx17Q9D0I4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Stx17Q9D0I4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Stx17Q9D0I4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Stx17Q9D0I4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Stx17Q9D0I4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Stx17Q9D0I4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Stx17Q9D0I4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Stx17Q9D0I4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Stx17Q9D0I4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Stx17Q9D0I4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Stx17Q9D0I4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Stx17Q9D0I4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Stx17Q9D0I4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Stx17Q9D0I4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Stx17Q9D0I4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Stx17Q9D0I4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Stx17Q9D0I4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Stx17Q9D0I4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Stx17Q9D0I4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Stx17Q9D0I4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Stx17Q9D0I4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Stx17Q9D0I4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Stx17Q9D0I4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Stx17Q9D0I4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Stx17Q9D0I4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Stx17Q9D0I4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Stx17Q9D0I4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Stx17Q9D0I4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Stx17Q9D0I4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Stx17Q9D0I4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Stx17Q9D0I4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Stx17Q9D0I4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Stx17Q9D0I4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Stx17Q9D0I4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Stx17Q9D0I4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Stx17Q9D0I4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Stx17Q9D0I4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Stx17Q9D0I4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Stx17Q9D0I4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Stx17Q9D0I4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Stx17Q9D0I4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Stx17Q9D0I4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40,2 ms