Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D3

Gsdme, Gasdermin-E, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmeQ9Z2D3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
GsdmeQ9Z2D3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
GsdmeQ9Z2D3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GsdmeQ9Z2D3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GsdmeQ9Z2D3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
GsdmeQ9Z2D3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GsdmeQ9Z2D3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
GsdmeQ9Z2D3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GsdmeQ9Z2D3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
GsdmeQ9Z2D3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
GsdmeQ9Z2D3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
GsdmeQ9Z2D3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GsdmeQ9Z2D3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
GsdmeQ9Z2D3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GsdmeQ9Z2D3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GsdmeQ9Z2D3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GsdmeQ9Z2D3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GsdmeQ9Z2D3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GsdmeQ9Z2D3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GsdmeQ9Z2D3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
GsdmeQ9Z2D3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GsdmeQ9Z2D3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GsdmeQ9Z2D3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
GsdmeQ9Z2D3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
GsdmeQ9Z2D3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GsdmeQ9Z2D3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GsdmeQ9Z2D3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GsdmeQ9Z2D3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GsdmeQ9Z2D3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GsdmeQ9Z2D3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GsdmeQ9Z2D3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GsdmeQ9Z2D3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GsdmeQ9Z2D3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GsdmeQ9Z2D3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GsdmeQ9Z2D3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GsdmeQ9Z2D3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GsdmeQ9Z2D3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GsdmeQ9Z2D3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
GsdmeQ9Z2D3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GsdmeQ9Z2D3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GsdmeQ9Z2D3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GsdmeQ9Z2D3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GsdmeQ9Z2D3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GsdmeQ9Z2D3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GsdmeQ9Z2D3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
GsdmeQ9Z2D3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GsdmeQ9Z2D3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GsdmeQ9Z2D3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GsdmeQ9Z2D3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GsdmeQ9Z2D3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GsdmeQ9Z2D3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
GsdmeQ9Z2D3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GsdmeQ9Z2D3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GsdmeQ9Z2D3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GsdmeQ9Z2D3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GsdmeQ9Z2D3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GsdmeQ9Z2D3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GsdmeQ9Z2D3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GsdmeQ9Z2D3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
GsdmeQ9Z2D3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
GsdmeQ9Z2D3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
GsdmeQ9Z2D3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GsdmeQ9Z2D3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GsdmeQ9Z2D3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GsdmeQ9Z2D3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GsdmeQ9Z2D3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GsdmeQ9Z2D3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
GsdmeQ9Z2D3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
GsdmeQ9Z2D3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GsdmeQ9Z2D3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GsdmeQ9Z2D3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GsdmeQ9Z2D3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GsdmeQ9Z2D3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GsdmeQ9Z2D3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GsdmeQ9Z2D3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GsdmeQ9Z2D3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GsdmeQ9Z2D3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GsdmeQ9Z2D3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GsdmeQ9Z2D3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GsdmeQ9Z2D3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GsdmeQ9Z2D3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GsdmeQ9Z2D3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GsdmeQ9Z2D3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GsdmeQ9Z2D3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GsdmeQ9Z2D3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GsdmeQ9Z2D3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GsdmeQ9Z2D3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GsdmeQ9Z2D3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GsdmeQ9Z2D3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GsdmeQ9Z2D3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GsdmeQ9Z2D3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GsdmeQ9Z2D3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GsdmeQ9Z2D3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GsdmeQ9Z2D3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GsdmeQ9Z2D3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GsdmeQ9Z2D3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GsdmeQ9Z2D3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GsdmeQ9Z2D3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GsdmeQ9Z2D3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GsdmeQ9Z2D3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187 ms