Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1M5

Nlrp5, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp5Q9R1M5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
Nlrp5Q9R1M5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Nlrp5Q9R1M5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Nlrp5Q9R1M5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Nlrp5Q9R1M5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Nlrp5Q9R1M5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Nlrp5Q9R1M5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Nlrp5Q9R1M5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Nlrp5Q9R1M5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Nlrp5Q9R1M5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Nlrp5Q9R1M5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Nlrp5Q9R1M5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Nlrp5Q9R1M5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Nlrp5Q9R1M5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Nlrp5Q9R1M5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Nlrp5Q9R1M5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Nlrp5Q9R1M5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Nlrp5Q9R1M5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Nlrp5Q9R1M5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Nlrp5Q9R1M5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Nlrp5Q9R1M5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nlrp5Q9R1M5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Nlrp5Q9R1M5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nlrp5Q9R1M5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Nlrp5Q9R1M5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Nlrp5Q9R1M5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Nlrp5Q9R1M5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Nlrp5Q9R1M5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Nlrp5Q9R1M5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Nlrp5Q9R1M5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Nlrp5Q9R1M5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Nlrp5Q9R1M5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Nlrp5Q9R1M5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nlrp5Q9R1M5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nlrp5Q9R1M5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nlrp5Q9R1M5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nlrp5Q9R1M5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nlrp5Q9R1M5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nlrp5Q9R1M5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nlrp5Q9R1M5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Nlrp5Q9R1M5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nlrp5Q9R1M5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nlrp5Q9R1M5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nlrp5Q9R1M5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Nlrp5Q9R1M5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nlrp5Q9R1M5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nlrp5Q9R1M5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Nlrp5Q9R1M5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nlrp5Q9R1M5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Nlrp5Q9R1M5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Nlrp5Q9R1M5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Nlrp5Q9R1M5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Nlrp5Q9R1M5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Nlrp5Q9R1M5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Nlrp5Q9R1M5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Nlrp5Q9R1M5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nlrp5Q9R1M5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Nlrp5Q9R1M5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Nlrp5Q9R1M5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Nlrp5Q9R1M5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nlrp5Q9R1M5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nlrp5Q9R1M5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nlrp5Q9R1M5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Nlrp5Q9R1M5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Nlrp5Q9R1M5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nlrp5Q9R1M5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nlrp5Q9R1M5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nlrp5Q9R1M5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Nlrp5Q9R1M5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Nlrp5Q9R1M5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Nlrp5Q9R1M5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nlrp5Q9R1M5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Nlrp5Q9R1M5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Nlrp5Q9R1M5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Nlrp5Q9R1M5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nlrp5Q9R1M5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Nlrp5Q9R1M5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nlrp5Q9R1M5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Nlrp5Q9R1M5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nlrp5Q9R1M5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nlrp5Q9R1M5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nlrp5Q9R1M5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nlrp5Q9R1M5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nlrp5Q9R1M5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nlrp5Q9R1M5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Nlrp5Q9R1M5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nlrp5Q9R1M5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nlrp5Q9R1M5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nlrp5Q9R1M5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nlrp5Q9R1M5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nlrp5Q9R1M5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nlrp5Q9R1M5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nlrp5Q9R1M5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nlrp5Q9R1M5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nlrp5Q9R1M5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nlrp5Q9R1M5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nlrp5Q9R1M5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nlrp5Q9R1M5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nlrp5Q9R1M5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nlrp5Q9R1M5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms