Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ28

Dph6, Diphthine--ammonia ligase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph6Q9CQ28 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
Dph6Q9CQ28 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Dph6Q9CQ28 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Dph6Q9CQ28 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Dph6Q9CQ28 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Dph6Q9CQ28 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Dph6Q9CQ28 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Dph6Q9CQ28 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Dph6Q9CQ28 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Dph6Q9CQ28 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Dph6Q9CQ28 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Dph6Q9CQ28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Dph6Q9CQ28 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Dph6Q9CQ28 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Dph6Q9CQ28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Dph6Q9CQ28 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Dph6Q9CQ28 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Dph6Q9CQ28 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Dph6Q9CQ28 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Dph6Q9CQ28 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Dph6Q9CQ28 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Dph6Q9CQ28 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Dph6Q9CQ28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Dph6Q9CQ28 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Dph6Q9CQ28 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Dph6Q9CQ28 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Dph6Q9CQ28 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Dph6Q9CQ28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Dph6Q9CQ28 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Dph6Q9CQ28 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Dph6Q9CQ28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Dph6Q9CQ28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Dph6Q9CQ28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Dph6Q9CQ28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Dph6Q9CQ28 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Dph6Q9CQ28 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Dph6Q9CQ28 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Dph6Q9CQ28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Dph6Q9CQ28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Dph6Q9CQ28 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dph6Q9CQ28 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Dph6Q9CQ28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Dph6Q9CQ28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Dph6Q9CQ28 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Dph6Q9CQ28 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Dph6Q9CQ28 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Dph6Q9CQ28 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Dph6Q9CQ28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Dph6Q9CQ28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Dph6Q9CQ28 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Dph6Q9CQ28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Dph6Q9CQ28 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Dph6Q9CQ28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Dph6Q9CQ28 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Dph6Q9CQ28 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Dph6Q9CQ28 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Dph6Q9CQ28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Dph6Q9CQ28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Dph6Q9CQ28 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Dph6Q9CQ28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Dph6Q9CQ28 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Dph6Q9CQ28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dph6Q9CQ28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dph6Q9CQ28 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Dph6Q9CQ28 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Dph6Q9CQ28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Dph6Q9CQ28 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Dph6Q9CQ28 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Dph6Q9CQ28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Dph6Q9CQ28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Dph6Q9CQ28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Dph6Q9CQ28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Dph6Q9CQ28 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Dph6Q9CQ28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Dph6Q9CQ28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Dph6Q9CQ28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Dph6Q9CQ28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Dph6Q9CQ28 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Dph6Q9CQ28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Dph6Q9CQ28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Dph6Q9CQ28 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Dph6Q9CQ28 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Dph6Q9CQ28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Dph6Q9CQ28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Dph6Q9CQ28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Dph6Q9CQ28 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Dph6Q9CQ28 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Dph6Q9CQ28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Dph6Q9CQ28 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Dph6Q9CQ28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Dph6Q9CQ28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Dph6Q9CQ28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Dph6Q9CQ28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Dph6Q9CQ28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Dph6Q9CQ28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Dph6Q9CQ28 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Dph6Q9CQ28 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Dph6Q9CQ28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Dph6Q9CQ28 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Dph6Q9CQ28 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms