Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,86■■■■□ 3,65
Hdhd2Q3UGR5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Hdhd2Q3UGR5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,11■■■■□ 3,21
Hdhd2Q3UGR5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,21
Hdhd2Q3UGR5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Hdhd2Q3UGR5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Hdhd2Q3UGR5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,15■■■■□ 3,06
Hdhd2Q3UGR5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Hdhd2Q3UGR5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,42■■■□□ 2,94
Hdhd2Q3UGR5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Hdhd2Q3UGR5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Hdhd2Q3UGR5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Hdhd2Q3UGR5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,69■■■□□ 2,82
Hdhd2Q3UGR5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,64■■■□□ 2,82
Hdhd2Q3UGR5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Hdhd2Q3UGR5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Hdhd2Q3UGR5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Hdhd2Q3UGR5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Hdhd2Q3UGR5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Hdhd2Q3UGR5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,2■■■□□ 2,75
Hdhd2Q3UGR5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Hdhd2Q3UGR5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Hdhd2Q3UGR5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Hdhd2Q3UGR5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Hdhd2Q3UGR5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Hdhd2Q3UGR5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Hdhd2Q3UGR5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Hdhd2Q3UGR5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Hdhd2Q3UGR5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Hdhd2Q3UGR5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Hdhd2Q3UGR5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Hdhd2Q3UGR5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Hdhd2Q3UGR5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Hdhd2Q3UGR5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Hdhd2Q3UGR5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Hdhd2Q3UGR5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Hdhd2Q3UGR5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,14■■■□□ 2,58
Hdhd2Q3UGR5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Hdhd2Q3UGR5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Hdhd2Q3UGR5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Hdhd2Q3UGR5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Hdhd2Q3UGR5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Hdhd2Q3UGR5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Hdhd2Q3UGR5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Hdhd2Q3UGR5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Hdhd2Q3UGR5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Hdhd2Q3UGR5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Hdhd2Q3UGR5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Hdhd2Q3UGR5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Hdhd2Q3UGR5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Hdhd2Q3UGR5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Hdhd2Q3UGR5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Hdhd2Q3UGR5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Hdhd2Q3UGR5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Hdhd2Q3UGR5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Hdhd2Q3UGR5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Hdhd2Q3UGR5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Hdhd2Q3UGR5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Hdhd2Q3UGR5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Hdhd2Q3UGR5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Hdhd2Q3UGR5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Hdhd2Q3UGR5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Hdhd2Q3UGR5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Hdhd2Q3UGR5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Hdhd2Q3UGR5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Hdhd2Q3UGR5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Hdhd2Q3UGR5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Hdhd2Q3UGR5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Hdhd2Q3UGR5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Hdhd2Q3UGR5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Hdhd2Q3UGR5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Hdhd2Q3UGR5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Hdhd2Q3UGR5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Hdhd2Q3UGR5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Hdhd2Q3UGR5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Hdhd2Q3UGR5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Hdhd2Q3UGR5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Hdhd2Q3UGR5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Hdhd2Q3UGR5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Hdhd2Q3UGR5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Hdhd2Q3UGR5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Hdhd2Q3UGR5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Hdhd2Q3UGR5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Hdhd2Q3UGR5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Hdhd2Q3UGR5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Hdhd2Q3UGR5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Hdhd2Q3UGR5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Hdhd2Q3UGR5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Hdhd2Q3UGR5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Hdhd2Q3UGR5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Hdhd2Q3UGR5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Hdhd2Q3UGR5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Hdhd2Q3UGR5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Hdhd2Q3UGR5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Hdhd2Q3UGR5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Hdhd2Q3UGR5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Hdhd2Q3UGR5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Hdhd2Q3UGR5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Hdhd2Q3UGR5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Hdhd2Q3UGR5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
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