Protein–RNA interactions for Protein: J3QM75

Scgb2b19, ABPBG19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b19J3QM75 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Scgb2b19J3QM75 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,43■■■■□ 3,58
Scgb2b19J3QM75 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,32■■■■□ 3,4
Scgb2b19J3QM75 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Scgb2b19J3QM75 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,28■■■■□ 3,24
Scgb2b19J3QM75 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Scgb2b19J3QM75 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
Scgb2b19J3QM75 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Scgb2b19J3QM75 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Scgb2b19J3QM75 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Scgb2b19J3QM75 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Scgb2b19J3QM75 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Scgb2b19J3QM75 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Scgb2b19J3QM75 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,66■■■□□ 2,98
Scgb2b19J3QM75 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Scgb2b19J3QM75 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Scgb2b19J3QM75 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,51■■■□□ 2,96
Scgb2b19J3QM75 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,19■■■□□ 2,9
Scgb2b19J3QM75 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Scgb2b19J3QM75 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Scgb2b19J3QM75 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Scgb2b19J3QM75 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Scgb2b19J3QM75 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Scgb2b19J3QM75 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Scgb2b19J3QM75 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Scgb2b19J3QM75 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
Scgb2b19J3QM75 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Scgb2b19J3QM75 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Scgb2b19J3QM75 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Scgb2b19J3QM75 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Scgb2b19J3QM75 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Scgb2b19J3QM75 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Scgb2b19J3QM75 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Scgb2b19J3QM75 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Scgb2b19J3QM75 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Scgb2b19J3QM75 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Scgb2b19J3QM75 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,06■■■□□ 2,72
Scgb2b19J3QM75 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Scgb2b19J3QM75 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,86■■■□□ 2,69
Scgb2b19J3QM75 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Scgb2b19J3QM75 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Scgb2b19J3QM75 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Scgb2b19J3QM75 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Scgb2b19J3QM75 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Scgb2b19J3QM75 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Scgb2b19J3QM75 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Scgb2b19J3QM75 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Scgb2b19J3QM75 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Scgb2b19J3QM75 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Scgb2b19J3QM75 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,35■■■□□ 2,61
Scgb2b19J3QM75 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Scgb2b19J3QM75 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Scgb2b19J3QM75 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Scgb2b19J3QM75 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Scgb2b19J3QM75 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Scgb2b19J3QM75 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,57
Scgb2b19J3QM75 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Scgb2b19J3QM75 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Scgb2b19J3QM75 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Scgb2b19J3QM75 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Scgb2b19J3QM75 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Scgb2b19J3QM75 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,94■■■□□ 2,54
Scgb2b19J3QM75 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Scgb2b19J3QM75 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,93■■■□□ 2,54
Scgb2b19J3QM75 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Scgb2b19J3QM75 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Scgb2b19J3QM75 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Scgb2b19J3QM75 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Scgb2b19J3QM75 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Scgb2b19J3QM75 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Scgb2b19J3QM75 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Scgb2b19J3QM75 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scgb2b19J3QM75 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Scgb2b19J3QM75 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Scgb2b19J3QM75 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Scgb2b19J3QM75 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Scgb2b19J3QM75 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Scgb2b19J3QM75 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Scgb2b19J3QM75 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Scgb2b19J3QM75 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Scgb2b19J3QM75 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Scgb2b19J3QM75 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Scgb2b19J3QM75 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Scgb2b19J3QM75 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Scgb2b19J3QM75 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Scgb2b19J3QM75 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Scgb2b19J3QM75 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Scgb2b19J3QM75 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Scgb2b19J3QM75 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Scgb2b19J3QM75 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Scgb2b19J3QM75 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Scgb2b19J3QM75 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Scgb2b19J3QM75 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Scgb2b19J3QM75 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Scgb2b19J3QM75 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Scgb2b19J3QM75 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Scgb2b19J3QM75 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Scgb2b19J3QM75 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Scgb2b19J3QM75 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Scgb2b19J3QM75 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
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