Protein–RNA interactions for Protein: Q61024

Asns, Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing], mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AsnsQ61024 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,24■■■■■ 4,99
AsnsQ61024 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
AsnsQ61024 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,18■■■■■ 4,34
AsnsQ61024 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,41■■■■■ 4,06
AsnsQ61024 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,08■■■■■ 4,01
AsnsQ61024 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,51■■■■□ 3,92
AsnsQ61024 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
AsnsQ61024 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
AsnsQ61024 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
AsnsQ61024 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
AsnsQ61024 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
AsnsQ61024 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,63■■■■□ 3,77
AsnsQ61024 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
AsnsQ61024 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,27■■■■□ 3,72
AsnsQ61024 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
AsnsQ61024 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
AsnsQ61024 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,34■■■■□ 3,57
AsnsQ61024 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,33■■■■□ 3,57
AsnsQ61024 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,3■■■■□ 3,56
AsnsQ61024 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,55
AsnsQ61024 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,11■■■■□ 3,53
AsnsQ61024 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
AsnsQ61024 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,95■■■■□ 3,51
AsnsQ61024 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
AsnsQ61024 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
AsnsQ61024 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,47
AsnsQ61024 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
AsnsQ61024 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
AsnsQ61024 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
AsnsQ61024 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
AsnsQ61024 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,57■■■■□ 3,44
AsnsQ61024 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,5■■■■□ 3,43
AsnsQ61024 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,5■■■■□ 3,43
AsnsQ61024 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
AsnsQ61024 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
AsnsQ61024 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,3■■■■□ 3,4
AsnsQ61024 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
AsnsQ61024 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,87■■■■□ 3,33
AsnsQ61024 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,84■■■■□ 3,33
AsnsQ61024 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
AsnsQ61024 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,62■■■■□ 3,29
AsnsQ61024 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
AsnsQ61024 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
AsnsQ61024 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
AsnsQ61024 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,42■■■■□ 3,26
AsnsQ61024 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,42■■■■□ 3,26
AsnsQ61024 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,37■■■■□ 3,25
AsnsQ61024 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
AsnsQ61024 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
AsnsQ61024 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,22■■■■□ 3,23
AsnsQ61024 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,19■■■■□ 3,22
AsnsQ61024 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
AsnsQ61024 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
AsnsQ61024 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
AsnsQ61024 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,91■■■■□ 3,18
AsnsQ61024 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
AsnsQ61024 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
AsnsQ61024 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
AsnsQ61024 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,79■■■■□ 3,16
AsnsQ61024 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
AsnsQ61024 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,68■■■■□ 3,14
AsnsQ61024 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
AsnsQ61024 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,56■■■■□ 3,12
AsnsQ61024 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
AsnsQ61024 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
AsnsQ61024 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,45■■■■□ 3,11
AsnsQ61024 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
AsnsQ61024 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,38■■■■□ 3,09
AsnsQ61024 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
AsnsQ61024 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
AsnsQ61024 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
AsnsQ61024 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,32■■■■□ 3,08
AsnsQ61024 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
AsnsQ61024 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,29■■■■□ 3,08
AsnsQ61024 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
AsnsQ61024 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,28■■■■□ 3,08
AsnsQ61024 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,28■■■■□ 3,08
AsnsQ61024 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
AsnsQ61024 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
AsnsQ61024 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
AsnsQ61024 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,14■■■■□ 3,06
AsnsQ61024 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
AsnsQ61024 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
AsnsQ61024 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
AsnsQ61024 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
AsnsQ61024 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
AsnsQ61024 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,97■■■■□ 3,03
AsnsQ61024 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
AsnsQ61024 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
AsnsQ61024 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
AsnsQ61024 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
AsnsQ61024 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
AsnsQ61024 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,89■■■■□ 3,02
AsnsQ61024 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,88■■■■□ 3,01
AsnsQ61024 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,85■■■■□ 3,01
AsnsQ61024 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,8■■■■□ 3
AsnsQ61024 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
AsnsQ61024 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,74■■■□□ 2,99
AsnsQ61024 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
AsnsQ61024 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms