Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Ndst4Q9EQW8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ndst4Q9EQW8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ndst4Q9EQW8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ndst4Q9EQW8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ndst4Q9EQW8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ndst4Q9EQW8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Ndst4Q9EQW8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Ndst4Q9EQW8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ndst4Q9EQW8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ndst4Q9EQW8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Ndst4Q9EQW8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ndst4Q9EQW8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Ndst4Q9EQW8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ndst4Q9EQW8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ndst4Q9EQW8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ndst4Q9EQW8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ndst4Q9EQW8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ndst4Q9EQW8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ndst4Q9EQW8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ndst4Q9EQW8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ndst4Q9EQW8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ndst4Q9EQW8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ndst4Q9EQW8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ndst4Q9EQW8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ndst4Q9EQW8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Ndst4Q9EQW8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ndst4Q9EQW8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ndst4Q9EQW8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ndst4Q9EQW8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ndst4Q9EQW8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ndst4Q9EQW8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Ndst4Q9EQW8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ndst4Q9EQW8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ndst4Q9EQW8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ndst4Q9EQW8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ndst4Q9EQW8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ndst4Q9EQW8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ndst4Q9EQW8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ndst4Q9EQW8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ndst4Q9EQW8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ndst4Q9EQW8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ndst4Q9EQW8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ndst4Q9EQW8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ndst4Q9EQW8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ndst4Q9EQW8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ndst4Q9EQW8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ndst4Q9EQW8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ndst4Q9EQW8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ndst4Q9EQW8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ndst4Q9EQW8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ndst4Q9EQW8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ndst4Q9EQW8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ndst4Q9EQW8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ndst4Q9EQW8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Ndst4Q9EQW8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ndst4Q9EQW8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ndst4Q9EQW8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ndst4Q9EQW8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ndst4Q9EQW8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Ndst4Q9EQW8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ndst4Q9EQW8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ndst4Q9EQW8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ndst4Q9EQW8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Ndst4Q9EQW8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ndst4Q9EQW8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ndst4Q9EQW8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ndst4Q9EQW8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ndst4Q9EQW8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ndst4Q9EQW8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ndst4Q9EQW8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ndst4Q9EQW8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ndst4Q9EQW8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ndst4Q9EQW8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ndst4Q9EQW8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ndst4Q9EQW8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ndst4Q9EQW8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ndst4Q9EQW8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ndst4Q9EQW8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ndst4Q9EQW8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ndst4Q9EQW8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Ndst4Q9EQW8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ndst4Q9EQW8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ndst4Q9EQW8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ndst4Q9EQW8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ndst4Q9EQW8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ndst4Q9EQW8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ndst4Q9EQW8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ndst4Q9EQW8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ndst4Q9EQW8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ndst4Q9EQW8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ndst4Q9EQW8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ndst4Q9EQW8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ndst4Q9EQW8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ndst4Q9EQW8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ndst4Q9EQW8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ndst4Q9EQW8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ndst4Q9EQW8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ndst4Q9EQW8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ndst4Q9EQW8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
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