Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2U0

Psma7, Proteasome subunit alpha type-7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma7Q9Z2U0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,62■■■■□ 3,61
Psma7Q9Z2U0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Psma7Q9Z2U0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Psma7Q9Z2U0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,07■■■■□ 3,37
Psma7Q9Z2U0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,94■■■■□ 3,18
Psma7Q9Z2U0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Psma7Q9Z2U0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Psma7Q9Z2U0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Psma7Q9Z2U0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Psma7Q9Z2U0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Psma7Q9Z2U0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,82■■■■□ 3
Psma7Q9Z2U0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Psma7Q9Z2U0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Psma7Q9Z2U0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Psma7Q9Z2U0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,42■■■□□ 2,94
Psma7Q9Z2U0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Psma7Q9Z2U0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Psma7Q9Z2U0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,24■■■□□ 2,91
Psma7Q9Z2U0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Psma7Q9Z2U0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Psma7Q9Z2U0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Psma7Q9Z2U0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Psma7Q9Z2U0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Psma7Q9Z2U0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Psma7Q9Z2U0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Psma7Q9Z2U0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Psma7Q9Z2U0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Psma7Q9Z2U0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Psma7Q9Z2U0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Psma7Q9Z2U0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Psma7Q9Z2U0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Psma7Q9Z2U0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Psma7Q9Z2U0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,18■■■□□ 2,74
Psma7Q9Z2U0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,14■■■□□ 2,73
Psma7Q9Z2U0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Psma7Q9Z2U0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Psma7Q9Z2U0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Psma7Q9Z2U0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Psma7Q9Z2U0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,74■■■□□ 2,67
Psma7Q9Z2U0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Psma7Q9Z2U0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Psma7Q9Z2U0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Psma7Q9Z2U0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Psma7Q9Z2U0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Psma7Q9Z2U0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Psma7Q9Z2U0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Psma7Q9Z2U0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Psma7Q9Z2U0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Psma7Q9Z2U0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Psma7Q9Z2U0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Psma7Q9Z2U0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Psma7Q9Z2U0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,05■■■□□ 2,56
Psma7Q9Z2U0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,03■■■□□ 2,56
Psma7Q9Z2U0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Psma7Q9Z2U0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Psma7Q9Z2U0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Psma7Q9Z2U0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Psma7Q9Z2U0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Psma7Q9Z2U0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Psma7Q9Z2U0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Psma7Q9Z2U0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Psma7Q9Z2U0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Psma7Q9Z2U0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Psma7Q9Z2U0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Psma7Q9Z2U0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Psma7Q9Z2U0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Psma7Q9Z2U0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Psma7Q9Z2U0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Psma7Q9Z2U0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Psma7Q9Z2U0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Psma7Q9Z2U0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Psma7Q9Z2U0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Psma7Q9Z2U0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Psma7Q9Z2U0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Psma7Q9Z2U0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Psma7Q9Z2U0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Psma7Q9Z2U0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Psma7Q9Z2U0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Psma7Q9Z2U0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Psma7Q9Z2U0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Psma7Q9Z2U0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Psma7Q9Z2U0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Psma7Q9Z2U0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Psma7Q9Z2U0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,38
Psma7Q9Z2U0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Psma7Q9Z2U0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Psma7Q9Z2U0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Psma7Q9Z2U0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Psma7Q9Z2U0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Psma7Q9Z2U0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Psma7Q9Z2U0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Psma7Q9Z2U0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Psma7Q9Z2U0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Psma7Q9Z2U0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Psma7Q9Z2U0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Psma7Q9Z2U0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Psma7Q9Z2U0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Psma7Q9Z2U0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Psma7Q9Z2U0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Psma7Q9Z2U0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms