Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Tubb2aQ7TMM9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,33■■■■□ 3,41
Tubb2aQ7TMM9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,99■■■■□ 3,35
Tubb2aQ7TMM9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Tubb2aQ7TMM9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Tubb2aQ7TMM9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Tubb2aQ7TMM9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Tubb2aQ7TMM9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Tubb2aQ7TMM9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Tubb2aQ7TMM9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Tubb2aQ7TMM9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Tubb2aQ7TMM9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Tubb2aQ7TMM9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Tubb2aQ7TMM9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Tubb2aQ7TMM9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Tubb2aQ7TMM9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Tubb2aQ7TMM9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Tubb2aQ7TMM9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Tubb2aQ7TMM9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,69■■■□□ 2,82
Tubb2aQ7TMM9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Tubb2aQ7TMM9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,45■■■□□ 2,78
Tubb2aQ7TMM9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Tubb2aQ7TMM9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Tubb2aQ7TMM9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
Tubb2aQ7TMM9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Tubb2aQ7TMM9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Tubb2aQ7TMM9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Tubb2aQ7TMM9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,66■■■□□ 2,66
Tubb2aQ7TMM9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
Tubb2aQ7TMM9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Tubb2aQ7TMM9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Tubb2aQ7TMM9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Tubb2aQ7TMM9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,54■■■□□ 2,64
Tubb2aQ7TMM9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
Tubb2aQ7TMM9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Tubb2aQ7TMM9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Tubb2aQ7TMM9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Tubb2aQ7TMM9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,43■■■□□ 2,62
Tubb2aQ7TMM9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Tubb2aQ7TMM9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Tubb2aQ7TMM9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Tubb2aQ7TMM9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Tubb2aQ7TMM9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Tubb2aQ7TMM9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Tubb2aQ7TMM9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Tubb2aQ7TMM9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Tubb2aQ7TMM9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Tubb2aQ7TMM9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Tubb2aQ7TMM9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Tubb2aQ7TMM9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Tubb2aQ7TMM9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Tubb2aQ7TMM9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Tubb2aQ7TMM9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Tubb2aQ7TMM9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Tubb2aQ7TMM9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Tubb2aQ7TMM9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Tubb2aQ7TMM9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Tubb2aQ7TMM9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Tubb2aQ7TMM9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Tubb2aQ7TMM9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Tubb2aQ7TMM9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Tubb2aQ7TMM9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Tubb2aQ7TMM9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Tubb2aQ7TMM9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Tubb2aQ7TMM9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Tubb2aQ7TMM9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
Tubb2aQ7TMM9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Tubb2aQ7TMM9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Tubb2aQ7TMM9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Tubb2aQ7TMM9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Tubb2aQ7TMM9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Tubb2aQ7TMM9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Tubb2aQ7TMM9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Tubb2aQ7TMM9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Tubb2aQ7TMM9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Tubb2aQ7TMM9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Tubb2aQ7TMM9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Tubb2aQ7TMM9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Tubb2aQ7TMM9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Tubb2aQ7TMM9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Tubb2aQ7TMM9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Tubb2aQ7TMM9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Tubb2aQ7TMM9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Tubb2aQ7TMM9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Tubb2aQ7TMM9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Tubb2aQ7TMM9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Tubb2aQ7TMM9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Tubb2aQ7TMM9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Tubb2aQ7TMM9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Tubb2aQ7TMM9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Tubb2aQ7TMM9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Tubb2aQ7TMM9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Tubb2aQ7TMM9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Tubb2aQ7TMM9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,55■■■□□ 2,32
Tubb2aQ7TMM9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Tubb2aQ7TMM9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Tubb2aQ7TMM9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Tubb2aQ7TMM9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Tubb2aQ7TMM9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Tubb2aQ7TMM9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms