Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,32■■■■■ 4,21
Rexo1Q7TT28 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Rexo1Q7TT28 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Rexo1Q7TT28 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Rexo1Q7TT28 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Rexo1Q7TT28 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,65■■■■□ 3,46
Rexo1Q7TT28 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,28■■■■□ 3,4
Rexo1Q7TT28 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,73■■■■□ 3,31
Rexo1Q7TT28 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,53■■■■□ 3,28
Rexo1Q7TT28 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Rexo1Q7TT28 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,21■■■■□ 3,23
Rexo1Q7TT28 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Rexo1Q7TT28 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Rexo1Q7TT28 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,69■■■■□ 3,14
Rexo1Q7TT28 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Rexo1Q7TT28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Rexo1Q7TT28 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,13
Rexo1Q7TT28 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,52■■■■□ 3,12
Rexo1Q7TT28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Rexo1Q7TT28 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Rexo1Q7TT28 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Rexo1Q7TT28 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Rexo1Q7TT28 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Rexo1Q7TT28 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
Rexo1Q7TT28 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Rexo1Q7TT28 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Rexo1Q7TT28 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Rexo1Q7TT28 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,77■■■■□ 3
Rexo1Q7TT28 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Rexo1Q7TT28 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Rexo1Q7TT28 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Rexo1Q7TT28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Rexo1Q7TT28 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,4■■■□□ 2,94
Rexo1Q7TT28 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,33■■■□□ 2,93
Rexo1Q7TT28 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Rexo1Q7TT28 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Rexo1Q7TT28 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,9
Rexo1Q7TT28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Rexo1Q7TT28 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Rexo1Q7TT28 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Rexo1Q7TT28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Rexo1Q7TT28 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Rexo1Q7TT28 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Rexo1Q7TT28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Rexo1Q7TT28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Rexo1Q7TT28 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Rexo1Q7TT28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Rexo1Q7TT28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,58■■■□□ 2,81
Rexo1Q7TT28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Rexo1Q7TT28 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,46■■■□□ 2,79
Rexo1Q7TT28 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Rexo1Q7TT28 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Rexo1Q7TT28 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Rexo1Q7TT28 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Rexo1Q7TT28 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Rexo1Q7TT28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Rexo1Q7TT28 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Rexo1Q7TT28 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Rexo1Q7TT28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Rexo1Q7TT28 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Rexo1Q7TT28 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Rexo1Q7TT28 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Rexo1Q7TT28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Rexo1Q7TT28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Rexo1Q7TT28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Rexo1Q7TT28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,84■■■□□ 2,69
Rexo1Q7TT28 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Rexo1Q7TT28 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,8■■■□□ 2,68
Rexo1Q7TT28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,76■■■□□ 2,68
Rexo1Q7TT28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Rexo1Q7TT28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Rexo1Q7TT28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Rexo1Q7TT28 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Rexo1Q7TT28 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,66■■■□□ 2,66
Rexo1Q7TT28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Rexo1Q7TT28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Rexo1Q7TT28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Rexo1Q7TT28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Rexo1Q7TT28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,41■■■□□ 2,62
Rexo1Q7TT28 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Rexo1Q7TT28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Rexo1Q7TT28 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Rexo1Q7TT28 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Rexo1Q7TT28 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Rexo1Q7TT28 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,57
Rexo1Q7TT28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Rexo1Q7TT28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Rexo1Q7TT28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Rexo1Q7TT28 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Rexo1Q7TT28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Rexo1Q7TT28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Rexo1Q7TT28 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Rexo1Q7TT28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Rexo1Q7TT28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Rexo1Q7TT28 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Rexo1Q7TT28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Rexo1Q7TT28 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Rexo1Q7TT28 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Rexo1Q7TT28 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Rexo1Q7TT28 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67,1 ms