Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
Rexo1Q7TT28 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rexo1Q7TT28 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rexo1Q7TT28 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rexo1Q7TT28 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rexo1Q7TT28 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rexo1Q7TT28 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Rexo1Q7TT28 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Rexo1Q7TT28 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Rexo1Q7TT28 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rexo1Q7TT28 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Rexo1Q7TT28 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rexo1Q7TT28 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rexo1Q7TT28 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Rexo1Q7TT28 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rexo1Q7TT28 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rexo1Q7TT28 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Rexo1Q7TT28 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Rexo1Q7TT28 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rexo1Q7TT28 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rexo1Q7TT28 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rexo1Q7TT28 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rexo1Q7TT28 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rexo1Q7TT28 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rexo1Q7TT28 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rexo1Q7TT28 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rexo1Q7TT28 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rexo1Q7TT28 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Rexo1Q7TT28 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rexo1Q7TT28 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rexo1Q7TT28 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rexo1Q7TT28 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rexo1Q7TT28 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rexo1Q7TT28 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Rexo1Q7TT28 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rexo1Q7TT28 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rexo1Q7TT28 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rexo1Q7TT28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rexo1Q7TT28 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rexo1Q7TT28 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rexo1Q7TT28 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rexo1Q7TT28 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rexo1Q7TT28 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rexo1Q7TT28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rexo1Q7TT28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rexo1Q7TT28 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rexo1Q7TT28 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rexo1Q7TT28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Rexo1Q7TT28 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rexo1Q7TT28 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rexo1Q7TT28 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rexo1Q7TT28 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Rexo1Q7TT28 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rexo1Q7TT28 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rexo1Q7TT28 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rexo1Q7TT28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rexo1Q7TT28 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rexo1Q7TT28 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rexo1Q7TT28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rexo1Q7TT28 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rexo1Q7TT28 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rexo1Q7TT28 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rexo1Q7TT28 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Rexo1Q7TT28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rexo1Q7TT28 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rexo1Q7TT28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Rexo1Q7TT28 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rexo1Q7TT28 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Rexo1Q7TT28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Rexo1Q7TT28 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rexo1Q7TT28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rexo1Q7TT28 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rexo1Q7TT28 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rexo1Q7TT28 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Rexo1Q7TT28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rexo1Q7TT28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rexo1Q7TT28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rexo1Q7TT28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rexo1Q7TT28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Rexo1Q7TT28 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rexo1Q7TT28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rexo1Q7TT28 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rexo1Q7TT28 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rexo1Q7TT28 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Rexo1Q7TT28 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Rexo1Q7TT28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rexo1Q7TT28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Rexo1Q7TT28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rexo1Q7TT28 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rexo1Q7TT28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rexo1Q7TT28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rexo1Q7TT28 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rexo1Q7TT28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rexo1Q7TT28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Rexo1Q7TT28 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rexo1Q7TT28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rexo1Q7TT28 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rexo1Q7TT28 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rexo1Q7TT28 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Rexo1Q7TT28 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms