Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
Ctnna3Q65CL1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ctnna3Q65CL1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ctnna3Q65CL1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ctnna3Q65CL1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Ctnna3Q65CL1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ctnna3Q65CL1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Ctnna3Q65CL1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ctnna3Q65CL1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ctnna3Q65CL1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ctnna3Q65CL1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ctnna3Q65CL1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Ctnna3Q65CL1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Ctnna3Q65CL1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ctnna3Q65CL1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ctnna3Q65CL1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ctnna3Q65CL1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Ctnna3Q65CL1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ctnna3Q65CL1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Ctnna3Q65CL1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Ctnna3Q65CL1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ctnna3Q65CL1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ctnna3Q65CL1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ctnna3Q65CL1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ctnna3Q65CL1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ctnna3Q65CL1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ctnna3Q65CL1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ctnna3Q65CL1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ctnna3Q65CL1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ctnna3Q65CL1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ctnna3Q65CL1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ctnna3Q65CL1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ctnna3Q65CL1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ctnna3Q65CL1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Ctnna3Q65CL1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ctnna3Q65CL1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ctnna3Q65CL1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ctnna3Q65CL1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ctnna3Q65CL1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ctnna3Q65CL1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ctnna3Q65CL1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ctnna3Q65CL1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ctnna3Q65CL1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ctnna3Q65CL1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ctnna3Q65CL1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ctnna3Q65CL1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ctnna3Q65CL1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ctnna3Q65CL1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ctnna3Q65CL1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ctnna3Q65CL1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ctnna3Q65CL1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ctnna3Q65CL1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ctnna3Q65CL1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ctnna3Q65CL1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ctnna3Q65CL1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Ctnna3Q65CL1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ctnna3Q65CL1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ctnna3Q65CL1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ctnna3Q65CL1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ctnna3Q65CL1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ctnna3Q65CL1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Ctnna3Q65CL1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ctnna3Q65CL1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ctnna3Q65CL1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ctnna3Q65CL1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ctnna3Q65CL1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Ctnna3Q65CL1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ctnna3Q65CL1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ctnna3Q65CL1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Ctnna3Q65CL1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ctnna3Q65CL1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ctnna3Q65CL1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Ctnna3Q65CL1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ctnna3Q65CL1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ctnna3Q65CL1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ctnna3Q65CL1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ctnna3Q65CL1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ctnna3Q65CL1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Ctnna3Q65CL1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ctnna3Q65CL1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ctnna3Q65CL1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ctnna3Q65CL1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ctnna3Q65CL1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Ctnna3Q65CL1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ctnna3Q65CL1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ctnna3Q65CL1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ctnna3Q65CL1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ctnna3Q65CL1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ctnna3Q65CL1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ctnna3Q65CL1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ctnna3Q65CL1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ctnna3Q65CL1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ctnna3Q65CL1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ctnna3Q65CL1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ctnna3Q65CL1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ctnna3Q65CL1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ctnna3Q65CL1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ctnna3Q65CL1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms