Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Cfap100Q80VN0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cfap100Q80VN0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cfap100Q80VN0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cfap100Q80VN0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cfap100Q80VN0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cfap100Q80VN0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Cfap100Q80VN0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Cfap100Q80VN0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cfap100Q80VN0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Cfap100Q80VN0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Cfap100Q80VN0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cfap100Q80VN0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cfap100Q80VN0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cfap100Q80VN0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cfap100Q80VN0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cfap100Q80VN0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Cfap100Q80VN0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cfap100Q80VN0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cfap100Q80VN0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cfap100Q80VN0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Cfap100Q80VN0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cfap100Q80VN0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cfap100Q80VN0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cfap100Q80VN0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cfap100Q80VN0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cfap100Q80VN0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cfap100Q80VN0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cfap100Q80VN0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cfap100Q80VN0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Cfap100Q80VN0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cfap100Q80VN0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cfap100Q80VN0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cfap100Q80VN0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cfap100Q80VN0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cfap100Q80VN0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cfap100Q80VN0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cfap100Q80VN0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Cfap100Q80VN0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cfap100Q80VN0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cfap100Q80VN0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cfap100Q80VN0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cfap100Q80VN0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cfap100Q80VN0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cfap100Q80VN0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cfap100Q80VN0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cfap100Q80VN0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cfap100Q80VN0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cfap100Q80VN0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cfap100Q80VN0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Cfap100Q80VN0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cfap100Q80VN0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cfap100Q80VN0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cfap100Q80VN0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cfap100Q80VN0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cfap100Q80VN0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Cfap100Q80VN0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cfap100Q80VN0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cfap100Q80VN0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cfap100Q80VN0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cfap100Q80VN0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Cfap100Q80VN0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cfap100Q80VN0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cfap100Q80VN0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cfap100Q80VN0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cfap100Q80VN0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cfap100Q80VN0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cfap100Q80VN0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Cfap100Q80VN0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Cfap100Q80VN0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cfap100Q80VN0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cfap100Q80VN0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cfap100Q80VN0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cfap100Q80VN0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cfap100Q80VN0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cfap100Q80VN0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cfap100Q80VN0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cfap100Q80VN0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cfap100Q80VN0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cfap100Q80VN0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cfap100Q80VN0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cfap100Q80VN0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Cfap100Q80VN0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cfap100Q80VN0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cfap100Q80VN0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cfap100Q80VN0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cfap100Q80VN0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Cfap100Q80VN0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Cfap100Q80VN0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cfap100Q80VN0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cfap100Q80VN0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cfap100Q80VN0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cfap100Q80VN0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cfap100Q80VN0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cfap100Q80VN0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cfap100Q80VN0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cfap100Q80VN0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Cfap100Q80VN0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cfap100Q80VN0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cfap100Q80VN0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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