RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prl2c2P04095 224 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vsnl1P62761 191 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mettl5Q8K1A0 209 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 March8Q9DBD2 286 aa29.25■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnai2A2AC93 623 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rsbn1lD3Z0K6 821 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sema4bQ62179 823 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fez2Q6TYB5 348 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Igdcc3Q8BQC3 813 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Efcab8Q8C9R9 203 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf287Q9EQB9 759 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Col11a2Q64739 1736 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scn9aQ62205 1984 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm45208A0A140LJ36 292 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rgs22G3UYX5 1258 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc4bP0C192 709 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt87Q6IMF0 495 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Camsap3Q80VC9 1252 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdhb5Q91XZ5 792 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt34Q9D646 392 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sema6bO54951 886 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdr2P97817 455 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Carmil2Q3V3V9 1296 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Galnt17Q7TT15 598 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa29.24■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp831A2ADM8 1628 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ano9P86044 747 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sap30bpQ02614 308 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kremen1Q99N43 473 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt18P05784 423 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nf2P46662 596 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tm4sf1Q64302 202 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sdccag8Q80UF4 717 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fsip1Q9D3V5 435 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tacc2Q9JJG0 1149 aa29.23■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Psmd14O35593 310 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nck2O55033 380 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Glrx3Q9CQM9 337 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem192Q9CXT7 266 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpinb12Q9D7P9 423 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Exoc3l2D3YUP5 789 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ifnar1P33896 590 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tsr1Q5SWD9 803 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc41Q8K1C9 807 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Xrcc4Q924T3 326 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Inpp4aQ9EPW0 939 aa29.22■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fdx1P46656 188 aa29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wdhd1P59328 1117 aa29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm7168A0AUV4 508 aa29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Otud7bB2RUR8 840 aa29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ces1aE9PYP1 563 aa29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ube3aO08759 870 aa29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klhdc9Q3USL1 350 aa29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dact1Q8R4A3 778 aa29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt79Q8VED5 531 aa29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tshz1Q5DTH5 1084 aa29.2■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcsk7Q61139 770 aa29.2■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam196bQ6GQV1 535 aa29.2■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrrc1Q80VQ1 524 aa29.2■■■□□ 2.27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm1993A6X8I0 212 aa29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SlxD3Z347 212 aa29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PurbO35295 324 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GalcP54818 684 aa29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 1810065E05RikQ5NC41 235 aa29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Irak1Q62406 710 aa29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc93Q7TQK5 629 aa29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dclk3Q8BWQ5 790 aa29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zbed3Q9D0L1 228 aa29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Armc3A2AU72 881 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sec14l1A8Y5H7 715 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Enc1O35709 589 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abcb4P21440 1276 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Saal1Q9D2C2 474 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc105Q9D4K7 499 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kctd1Q5M956 257 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Best3Q6H1V1 669 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AacsQ9D2R0 672 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem191cQ9JJB1 302 aa29.19■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Top1Q04750 767 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa29.18■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gpt2Q8BGT5 522 aa29.18■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rab3il1Q8VDV3 383 aa29.18■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttll1Q91V51 423 aa29.18■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sar1bQ9CQC9 198 aa29.18■■■□□ 2.26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Copb2O55029 905 aa29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.7 ms