Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT15

Galnt17, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galnt17Q7TT15 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,31■■■■■ 4,52
Galnt17Q7TT15 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
Galnt17Q7TT15 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Galnt17Q7TT15 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Galnt17Q7TT15 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,22■■■■□ 3,71
Galnt17Q7TT15 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Galnt17Q7TT15 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,65■■■■□ 3,62
Galnt17Q7TT15 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,42■■■■□ 3,58
Galnt17Q7TT15 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,35■■■■□ 3,57
Galnt17Q7TT15 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Galnt17Q7TT15 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Galnt17Q7TT15 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Galnt17Q7TT15 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Galnt17Q7TT15 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,26■■■■□ 3,4
Galnt17Q7TT15 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,06■■■■□ 3,36
Galnt17Q7TT15 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Galnt17Q7TT15 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,91■■■■□ 3,34
Galnt17Q7TT15 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,33
Galnt17Q7TT15 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Galnt17Q7TT15 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Galnt17Q7TT15 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Galnt17Q7TT15 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Galnt17Q7TT15 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Galnt17Q7TT15 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Galnt17Q7TT15 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Galnt17Q7TT15 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,26■■■■□ 3,23
Galnt17Q7TT15 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,25■■■■□ 3,23
Galnt17Q7TT15 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Galnt17Q7TT15 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Galnt17Q7TT15 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Galnt17Q7TT15 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Galnt17Q7TT15 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,76■■■■□ 3,15
Galnt17Q7TT15 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Galnt17Q7TT15 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Galnt17Q7TT15 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Galnt17Q7TT15 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Galnt17Q7TT15 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,26■■■■□ 3,08
Galnt17Q7TT15 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Galnt17Q7TT15 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Galnt17Q7TT15 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Galnt17Q7TT15 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Galnt17Q7TT15 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Galnt17Q7TT15 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Galnt17Q7TT15 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Galnt17Q7TT15 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Galnt17Q7TT15 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Galnt17Q7TT15 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Galnt17Q7TT15 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Galnt17Q7TT15 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Galnt17Q7TT15 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Galnt17Q7TT15 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,58■■■□□ 2,97
Galnt17Q7TT15 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Galnt17Q7TT15 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Galnt17Q7TT15 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Galnt17Q7TT15 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Galnt17Q7TT15 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Galnt17Q7TT15 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,47■■■□□ 2,95
Galnt17Q7TT15 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Galnt17Q7TT15 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Galnt17Q7TT15 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Galnt17Q7TT15 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Galnt17Q7TT15 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Galnt17Q7TT15 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Galnt17Q7TT15 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Galnt17Q7TT15 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Galnt17Q7TT15 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Galnt17Q7TT15 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Galnt17Q7TT15 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,11■■■□□ 2,89
Galnt17Q7TT15 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Galnt17Q7TT15 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Galnt17Q7TT15 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Galnt17Q7TT15 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Galnt17Q7TT15 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,95■■■□□ 2,86
Galnt17Q7TT15 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
Galnt17Q7TT15 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Galnt17Q7TT15 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,81■■■□□ 2,84
Galnt17Q7TT15 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Galnt17Q7TT15 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,74■■■□□ 2,83
Galnt17Q7TT15 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Galnt17Q7TT15 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Galnt17Q7TT15 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Galnt17Q7TT15 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Galnt17Q7TT15 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Galnt17Q7TT15 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Galnt17Q7TT15 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Galnt17Q7TT15 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,48■■■□□ 2,79
Galnt17Q7TT15 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Galnt17Q7TT15 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Galnt17Q7TT15 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Galnt17Q7TT15 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Galnt17Q7TT15 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Galnt17Q7TT15 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Galnt17Q7TT15 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Galnt17Q7TT15 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Galnt17Q7TT15 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Galnt17Q7TT15 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Galnt17Q7TT15 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Galnt17Q7TT15 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Galnt17Q7TT15 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Galnt17Q7TT15 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53,3 ms